计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 768|回复 Reply: 5
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[波函数分析求助] RDG分析与vmd显示问题求助

[复制链接 Copy URL]

4

帖子

0

威望

159

eV
积分
163

Level 3 能力者

请问可以帮忙看一下,为什么我的VMD显示的RDG会是黑色的,请问有什么解决办法吗

图片1.png (322.69 KB, 下载次数 Times of downloads: 27)

图片1.png

6万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
120114

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2024-4-20 15:18:43 | 只看该作者 Only view this author
用Multiwfn+VMD做RDG分析时的一些要点和常见问题
http://sobereva.com/291http://bbs.keinsci.com/thread-1206-1-1.html
看上文“怎么我绘制出来的RDG等值面都是灰色的?” 部分

另外,似乎你要考察的是分子间相互作用,这种情况强烈建议用IGMH代替RDG
使用Multiwfn做IGMH分析非常清晰直观地展现化学体系中的相互作用
http://sobereva.com/621http://bbs.keinsci.com/thread-28147-1-1.html
直观解释分子间相互作用如何影响不对称催化:Nature Chemistry上一个很好的IGMH分析范例
http://sobereva.com/700http://bbs.keinsci.com/thread-43122-1-1.html
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

351

帖子

0

威望

2085

eV
积分
2436

Level 5 (御坂)

3#
发表于 Post on 2024-4-22 08:12:15 | 只看该作者 Only view this author
试试这个帖子里4楼的链接
http://bbs.keinsci.com/thread-28203-1-1.html

351

帖子

0

威望

2085

eV
积分
2436

Level 5 (御坂)

4#
发表于 Post on 2024-4-22 08:12:18 | 只看该作者 Only view this author
试试这个帖子里4楼的链接
http://bbs.keinsci.com/thread-28203-1-1.html

4

帖子

0

威望

159

eV
积分
163

Level 3 能力者

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-4-22 17:33:51 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-4-20 15:18
用Multiwfn+VMD做RDG分析时的一些要点和常见问题
http://sobereva.com/291(http://bbs.keinsci.com/threa ...

好的,我再仔细研究一下,后面也学习一下IGMH分析,谢谢

4

帖子

0

威望

159

eV
积分
163

Level 3 能力者

6#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-4-22 17:34:17 | 只看该作者 Only view this author
sai77 发表于 2024-4-22 08:12
试试这个帖子里4楼的链接
http://bbs.keinsci.com/thread-28203-1-1.html

好的,我去试试,谢谢

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2025-8-14 20:27 , Processed in 0.405058 second(s), 29 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list