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[GROMACS] 使用gmx rmsf分析时xvg文件中存在来回波动

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如题所示,使用gmx rmsf命令分析蛋白质+小分子配体和聚合物+蛋白质+小分子体系中蛋白质组的rmsf时,生成的xvg文件出现了某个残基来回波折,如图所示。请问各位大佬出现这种现象的原因是什么呢?该如何解决呢?

202404242245516296..png (142.75 KB, 下载次数 Times of downloads: 7)

两个体系蛋白质组rmsf值

两个体系蛋白质组rmsf值

peg_protein_rmsf.xvg

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聚合物+蛋白质体系

oph_protein_rmsf.xvg

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蛋白质体系

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2#
发表于 Post on 2024-4-25 05:55:26 | 只看该作者 Only view this author
估计是残基号不连续所致
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