计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
楼主 Author: alystone
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[Gaussian/gview] 用gaussian程序怎么生成.47文件

[复制链接 Copy URL]

154

帖子

0

威望

613

eV
积分
767

Level 4 (黑子)

16#
发表于 Post on 2020-3-31 09:41:40 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-3-31 02:47
具体说报什么错
表达不清楚就上传压缩后的输入输出文件

好的,这就是我的输入和输出文件,麻烦老师帮我看看问题出在哪里,谢谢老师!

高斯NBO生成47文件错误-输入和输出文件.zip

16.65 KB, 下载次数 Times of downloads: 3

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112486

管理员

公社社长

17#
发表于 Post on 2020-4-1 03:22:25 | 只看该作者 Only view this author
Q-Chembio-llg 发表于 2020-3-31 09:41
好的,这就是我的输入和输出文件,麻烦老师帮我看看问题出在哪里,谢谢老师!

对半经验波函数没法用自带的NBO 3.1做分析
就算抛开这个问题不谈,file=后面也不能用空格,而且后面应当是文件名而不能是某个目录名。

说清楚到底想用NBO研究什么,以便于给你建议用什么方式代替当前做法。用Multiwfn能做多得多的分析。DFT算不动的情况可以用Multiwfn结合xtb产生的波函数做分析,比半经验都快得多。

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

154

帖子

0

威望

613

eV
积分
767

Level 4 (黑子)

18#
发表于 Post on 2020-4-4 09:26:54 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-4-1 03:22
对半经验波函数没法用自带的NBO 3.1做分析
就算抛开这个问题不谈,file=后面也不能用空格,而且后面应当 ...

谢谢Sob老师指点。我就是想做NBO分析来看一下关于氢键的那个donnor-accepter二阶微扰能。看看老师能不能给我推荐一个其它的能做这个的好方法。谢谢老师!

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112486

管理员

公社社长

19#
发表于 Post on 2020-4-6 20:39:53 | 只看该作者 Only view this author
Q-Chembio-llg 发表于 2020-4-4 09:26
谢谢Sob老师指点。我就是想做NBO分析来看一下关于氢键的那个donnor-accepter二阶微扰能。看看老师能不能 ...

E2分析对于研究氢键基本没有价值,而且还很有误导性。看此文靠后部分的相关说明
Multiwfn支持的弱相互作用的分析方法概览
http://sobereva.com/252
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

155

帖子

0

威望

667

eV
积分
822

Level 4 (黑子)

20#
发表于 Post on 2023-8-23 17:27:59 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-11-28 18:56
用pop=nboread关键词,输入文件末尾空一行写比如

$NBO archive file=c:\ltwd $END,就会产生c:\ltwd.47
...

老师,您好,我使用Gaussian程序产生.47文件,关键词是pop=(full,nboread),然后输入文件末尾写的是$NBO archive file=/HOME/JFYANG/CO-WORK/compound1 $END,但是生成不了,请问有可能是什么原因啊

1万

帖子

0

威望

7402

eV
积分
18170

Level 6 (一方通行)

21#
发表于 Post on 2023-8-23 18:01:47 | 只看该作者 Only view this author
yangjunfang 发表于 2023-8-23 10:27
老师,您好,我使用Gaussian程序产生.47文件,关键词是pop=(full,nboread),然后输入文件末尾写的是$NBO  ...

高斯输出文件有报错吗?stderr有报错吗?
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

155

帖子

0

威望

667

eV
积分
822

Level 4 (黑子)

22#
发表于 Post on 2023-8-23 18:50:14 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2023-8-23 18:01
高斯输出文件有报错吗?stderr有报错吗?

有报错,下面是报错信息

捕获.PNG (19.12 KB, 下载次数 Times of downloads: 11)

捕获.PNG

1万

帖子

0

威望

7402

eV
积分
18170

Level 6 (一方通行)

23#
发表于 Post on 2023-8-23 23:07:42 | 只看该作者 Only view this author
yangjunfang 发表于 2023-8-23 11:50
有报错,下面是报错信息

看起来可能是NBO没装对或者和高斯没有接对(环境变量等设置不对)
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112486

管理员

公社社长

24#
发表于 Post on 2023-8-24 04:41:56 | 只看该作者 Only view this author
yangjunfang 发表于 2023-8-23 17:27
老师,您好,我使用Gaussian程序产生.47文件,关键词是pop=(full,nboread),然后输入文件末尾写的是$NBO  ...

确保file里的文件夹是存在的

或者用Multiwfn产生。Multiwfn载入fch文件,主功能100的主功能2,直接有选项产生.47文件
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

155

帖子

0

威望

667

eV
积分
822

Level 4 (黑子)

25#
发表于 Post on 2023-8-24 09:02:45 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-8-24 04:41
确保file里的文件夹是存在的

或者用Multiwfn产生。Multiwfn载入fch文件,主功能100的主功能2,直接有 ...

好的,谢谢您

155

帖子

0

威望

667

eV
积分
822

Level 4 (黑子)

26#
发表于 Post on 2023-8-24 10:15:39 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2023-8-23 23:07
看起来可能是NBO没装对或者和高斯没有接对(环境变量等设置不对)

那这种情况怎么弄呢?麻烦您指导一下

155

帖子

0

威望

667

eV
积分
822

Level 4 (黑子)

27#
发表于 Post on 2023-8-24 10:16:27 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 yangjunfang 于 2023-8-24 10:20 编辑
sobereva 发表于 2023-8-24 04:41
确保file里的文件夹是存在的

或者用Multiwfn产生。Multiwfn载入fch文件,主功能100的主功能2,直接有 ...

老师,这个fchk文件是Gaussian优化的结果文件就可以吗,我输入fchk文件之后出现了这样的错误

捕获.PNG (8.4 KB, 下载次数 Times of downloads: 9)

捕获.PNG

1万

帖子

0

威望

7402

eV
积分
18170

Level 6 (一方通行)

28#
发表于 Post on 2023-8-24 17:12:05 | 只看该作者 Only view this author
yangjunfang 发表于 2023-8-24 03:15
那这种情况怎么弄呢?麻烦您指导一下

仔细检查一下安装步骤是否和安装教程严格相符,系统要求是否符合
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112486

管理员

公社社长

29#
发表于 Post on 2023-8-24 21:25:22 | 只看该作者 Only view this author
yangjunfang 发表于 2023-8-24 10:16
老师,这个fchk文件是Gaussian优化的结果文件就可以吗,我输入fchk文件之后出现了这样的错误

提示里已经解释得极其清楚了
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

15

帖子

0

威望

431

eV
积分
446

Level 3 能力者

30#
发表于 Post on 2023-9-11 10:52:00 | 只看该作者 Only view this author
yangjunfang 发表于 2023-8-23 17:27
老师,您好,我使用Gaussian程序产生.47文件,关键词是pop=(full,nboread),然后输入文件末尾写的是$NBO  ...

1.gaussian生成.47文件 在指定文件夹的输入文件中输入$NBO ARCHIVE $END 即可,不需要路径
2.fchk文件在指定文件夹计算终端中输入 formchk 文件名.chk生成fchk文件,然后打开multiwfn,拖入即可

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-26 18:39 , Processed in 0.247145 second(s), 23 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list