Gromacs常用命令分享

Cribug · 发表于 Post on 2024-5-22 22:43:31

整理了一些gmx常用命令，比较具有个人色彩，但是是通用的。
可以以此为基础，根据自己的实际需要建立属于自己命令库。
需要自取。

emmmmm · 发表于 Post on 2024-6-1 10:27:20

你好，我想问一下windows系统下 gromacs调用脚本的命令有吗

Cribug · 发表于 Post on 2024-6-11 13:23:41

emmmmm 发表于 2024-6-1 10:27
你好，我想问一下windows系统下 gromacs调用脚本的命令有吗

这个我不太了解，应该是有用的吧

xptracy · 发表于 Post on 2024-6-11 14:03:37

感谢分享

gaotianliang · 发表于 Post on 2024-7-12 21:00:54

感谢分享

xliu97 · 发表于 Post on 2025-3-22 00:57:49

感谢分享。另外借楼我想请教一下,我使用gmx trjconv命令得到的gro文件结合VMD查看我的胶束体系，但是里面的胶束被盒子切开不完整，-pbc mol/-pbc cluster/-pbc nojump这几个命令的区别是什么？

Cribug · 发表于 Post on 2025-4-14 13:01:57

xliu97 发表于 2025-3-22 00:57
感谢分享。另外借楼我想请教一下,我使用gmx trjconv命令得到的gro文件结合VMD查看我的胶束体系，但是里面的 ...

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