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楼主 Author: whtu
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[综合交流] 离子液体之间相互作用能计算问题

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发表于 Post on 2016-12-5 16:55:13 | 只看该作者 Only view this author
老师,抱歉。打错了,是溶剂化效应,已改正过来。

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发表于 Post on 2016-12-6 00:36:06 | 只看该作者 Only view this author
1130240115 发表于 2016-12-4 08:11
老师这种在溶剂化效应下的热力学量是指吉布斯自由能变?

气相下那些热力学量在溶剂下都能算
但通过隐式溶剂模型,能严格算的只有溶剂下的自由能,而溶剂下的焓只是近似的
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2016-12-8 16:55:02 | 只看该作者 Only view this author
谢谢老师。如果严格计算,应该计算吉布斯自由能。我看文献一般用吉布斯自由能变计算反应的活化能,或者根据吉布斯自由能变判断过程是否能自发进行。也有通过吉布斯自由能变计算平衡常数。但是不知道用吸附前后的吉布斯自由能变能否表示吸附的强弱。

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发表于 Post on 2016-12-8 17:44:04 | 只看该作者 Only view this author
1130240115 发表于 2016-12-8 16:55
谢谢老师。如果严格计算,应该计算吉布斯自由能。我看文献一般用吉布斯自由能变计算反应的活化能,或者根据 ...

可以
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2016-12-8 18:50:46 | 只看该作者 Only view this author
谢谢老师。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-12-19 09:45:43 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-12-4 00:27
不能说“Gaussian算的是binding energy”,而是你想用高斯算什么就能算什么
对于考察你的问题,在隐式溶 ...

谢谢sob老师。我想请问一下,在隐式溶剂模型下计算,溶剂该怎么选择?
1)在单一组分下,如Methanol(在高薪里面溶剂选methanol)、离子液体(在高斯里面则需自己定义介电常数等)?
2)在混合条件下,如Methanol+离子液体,这个时候在高斯里面又怎么选溶剂?而且混合还有不同配比的情况?

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发表于 Post on 2016-12-19 10:41:07 | 只看该作者 Only view this author
whtu 发表于 2016-12-19 09:45
谢谢sob老师。我想请问一下,在隐式溶剂模型下计算,溶剂该怎么选择?
1)在单一组分下,如Methanol(在 ...

高斯里面的ionic模型结果比较扯淡,单一离子液体的话你选acetonitrile就行了

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-12-19 12:40:39 | 只看该作者 Only view this author
wbn 发表于 2016-12-19 10:41
高斯里面的ionic模型结果比较扯淡,单一离子液体的话你选acetonitrile就行了

谢谢。我想问一下单一离子液体的话选acetonitrile,这是基于什么考虑的?

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发表于 Post on 2016-12-19 23:01:36 | 只看该作者 Only view this author
whtu 发表于 2016-12-19 12:40
谢谢。我想问一下单一离子液体的话选acetonitrile,这是基于什么考虑的?

它们的极化率比较相似,因此溶质分子在离子液体中实际感受岛的介电常数应该与acetonitrile比较相似,而不是离子液体测得的介电常数,which含有ionic特性的影响

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-12-21 09:38:58 | 只看该作者 Only view this author
wbn 发表于 2016-12-19 23:01
它们的极化率比较相似,因此溶质分子在离子液体中实际感受岛的介电常数应该与acetonitrile比较相似,而不 ...

谢谢。那如果是两者混合的情况下有怎么考虑呢?

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发表于 Post on 2016-12-21 12:35:20 | 只看该作者 Only view this author
whtu 发表于 2016-12-21 09:38
谢谢。那如果是两者混合的情况下有怎么考虑呢?

不知道

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发表于 Post on 2018-8-4 17:33:25 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-12-4 00:27
不能说“Gaussian算的是binding energy”,而是你想用高斯算什么就能算什么
对于考察你的问题,在隐式溶 ...

老师,不是说离子液体不适合隐式溶剂模型吗?
在计算溶质与离子液体相互作用能的时候,是否可以在溶质的周围放几个离子液体,同时也设定SMD溶剂模型的各种参数,这样计算出来的相互作用能是不是更准确?

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发表于 Post on 2018-8-5 03:24:31 | 只看该作者 Only view this author
易兰0053 发表于 2018-8-4 17:33
老师,不是说离子液体不适合隐式溶剂模型吗?
在计算溶质与离子液体相互作用能的时候,是否可以在溶质的 ...


是。准确得多
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发表于 Post on 2018-8-6 05:57:57 | 只看该作者 Only view this author
易兰0053 发表于 2018-8-4 17:33
老师,不是说离子液体不适合隐式溶剂模型吗?
在计算溶质与离子液体相互作用能的时候,是否可以在溶质的 ...

也有专门对离子液体用的隐式溶剂模型,结果也还不错,有兴趣可参考
J. Phys. Chem. B 2012, 116, 9122−9129
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发表于 Post on 2018-8-6 08:51:00 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-8-6 05:57
也有专门对离子液体用的隐式溶剂模型,结果也还不错,有兴趣可参考
J. Phys. Chem. B 2012, 116, 9122&# ...

嗯,我学习学习。非常感谢sob老师!

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