使用mcpb参数化金属（锌）蛋白过程中用到Gaussian09优化结构，如何选择方法和基组？

YuniJ · 发表于 Post on 2024-5-25 11:21:43

如题所示，量子化学计算新手，想请教各位老师们：通过mcpb.py参数化金属蛋白（含ZN）过程中利用Gaussian09优化结构，其中包括small和large模型，请问应该如何选择方法和基组? 上传了三个由mcpb.py -s 1生成的高斯输入文件，谢谢各位老师指导！

sobereva · 发表于 Post on 2024-5-26 04:25:21

我不用mcpb.py。对于结构优化的目的，PBE0/def2-SVP是可以接受的下限，鉴于当前的体系不小，用这个级别可以接受。记得Gaussian里PBE0要写成PBE1PBE

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[Gaussian/gview] 使用mcpb参数化金属（锌）蛋白过程中用到Gaussian09优化结构，如何选择方法和基组？