在autoff 中用OPLS-2009IL力场生成硫酸根拓扑文件，但是键参数感觉不太对，

Simll · 发表于 Post on 2024-6-18 21:10:15

我查了下 OPLSAA力场中bond_coeff为K和r，其单位分别是kcal/mol/Å2和Å。用这个autoff生成的感觉不太一样，是单位不同导致的吗

Yuki_ · 发表于 Post on 2024-9-14 09:39:31

好像是的，因为autoff中的势阱深度的单位是(kJ·mol-1)，其他参数估计也是和lammps中的real单位制的单位会有所不同

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[Lammps] 在autoff 中用OPLS-2009IL力场生成硫酸根拓扑文件，但是键参数感觉不太对，