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[新手求助] IRC得到的产物进行优化后结构变化很大

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采用TS找到过渡态,初猜了很多种结构,最后得到的过渡态都一样,虚频振动也几乎一样,所以就觉得应该找对了过渡态,进行IRC计算,一端结构确实是反应物,然后把另一端的进行结构优化,但是优化后的结构变化很大,和虚频的振动方向也不一样,我以为是没有走到极小点,就将IRC的产物端设了60个点,结果45步就停止,得到的结构和刚开始用IRC计算得到的没多大差别,再进行结构优化,结构又变化很大,这可能是什么原因呢?如果取优化的结构作为产物,又和虚频振动的方向偏差很远。老师,我应该怎么做呢?图1是IRC得到的产物,图2是产物优化后的结构

IRC得到的结构.png (60.25 KB, 下载次数 Times of downloads: 32)

IRC得到的结构.png

优化后的结构.png (80.19 KB, 下载次数 Times of downloads: 41)

优化后的结构.png

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发表于 Post on 2016-12-14 00:16:07 | 只看该作者 Only view this author
如果IRC向产物一端你设了60个点但45个点就停了(提示已找到极小点),拿这个结构优化结构变化又很大,那么在优化的时候注意把步长上限设小,比如opt(calcfc,maxstep=5,notrust),看看结果如何。
如果变化还很大,那说明IRC跑得不很精确,过早认为到了极小点,可以IRC的时候用calcall看看是否能跑得更长。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-12-14 08:35:23 | 只看该作者 Only view this author
谢谢老师,我试试

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-12-18 19:26:29 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-12-14 00:16
如果IRC向产物一端你设了60个点但45个点就停了(提示已找到极小点),拿这个结构优化结构变化又很大,那么 ...

老师,我将优化的步长变小,得到的结构还是变化很大,可是按照虚频振动的方向来看,产物应该是没有优化前的产物,即IRC得到的产物,是因为过渡态错了么?有没有可能IRC得到的产物和优化后的结构之间存在一个过渡态?之所以这样猜测,我是看到优化能量曲线先平稳一段,然后突然增加,然后又降低至平稳

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发表于 Post on 2016-12-18 19:51:11 | 只看该作者 Only view this author
维维最爱小黄人 发表于 2016-12-18 19:26
老师,我将优化的步长变小,得到的结构还是变化很大,可是按照虚频振动的方向来看,产物应该是没有优化前 ...


没具体信息说不清楚
如果走IRC时候用了calcall而且IRC足够长,末尾的点不应当和极小点偏离多大
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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