计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 649|回复 Reply: 4
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[CP2K] 求助:CP2K集合变量查找的程序

[复制链接 Copy URL]

138

帖子

0

威望

805

eV
积分
943

Level 4 (黑子)

各位老师们好,我有一个比较复杂的异构化,想问一下如果用CP2K来做的话,有没有那种能够衡量下异构化前后一些几何参数的变化,或者是能够提供一些集合变量建议的程序呀?谢谢

1060

帖子

0

威望

3256

eV
积分
4316

Level 6 (一方通行)

2#
发表于 Post on 2024-7-5 15:58:42 | 只看该作者 Only view this author
什么体系?
盲猜,异构化是分子体系吧? 应该不是晶体这类的周期性体系?

如果是分子体系,其实不太适合用 CP2K,应该选用 Gaussian, Orca 这类的程序来计算

138

帖子

0

威望

805

eV
积分
943

Level 4 (黑子)

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-7-5 16:07:23 | 只看该作者 Only view this author
乐平 发表于 2024-7-5 15:58
什么体系?
盲猜,异构化是分子体系吧? 应该不是晶体这类的周期性体系?

是的,分子体系,谢谢老师的建议,我来看下这两个程序

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112354

管理员

公社社长

4#
发表于 Post on 2024-7-7 17:30:50 | 只看该作者 Only view this author
分子体系算异构化问题通常不牵扯集合变量,似乎你想多了、把问题搞复杂了
通常搜索过渡态和极小点、跑IRC就足够说明异构化过程中结构变化情况了
参考
简谈Gaussian里找过渡态的关键词opt=TS和QST2、3
http://sobereva.com/460http://bbs.keinsci.com/thread-12093-1-1.html
在Gaussian中计算IRC的方法和常见问题
http://sobereva.com/400http://bbs.keinsci.com/thread-7736-1-1.html

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

138

帖子

0

威望

805

eV
积分
943

Level 4 (黑子)

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-7-21 22:43:05 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-7-7 17:30
分子体系算异构化问题通常不牵扯集合变量,似乎你想多了、把问题搞复杂了
通常搜索过渡态和极小点、跑IRC ...

谢谢老师,我试试

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-24 03:53 , Processed in 0.204267 second(s), 22 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list