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[新手求助] 优化Ni金属配合物结构的键角和构型与理论结构出入很大

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本帖最后由 squirrelS 于 2024-8-20 12:49 编辑

1 最近在优化经典的苊醌二亚胺NiBr2配合物的结构,泛函用的是PBE0,基组定义的混合基组,C H N O Br 使用的是6-31G*,Ni使用的是SDD赝势基组。优化后NiBr2变成了一条直线。
2 将Br也使用了SDD赝势基组,Ni-Br键长变短,仍然是Br-Ni-Br呈直线结构
3 更换了泛函B3LYP, 更换了基组(C H N O Br 使用的是def2-SVP,Ni使用的def2-TZVP),Ni从正四面体构型变成了平面结构
请问如何定义才能得到结构正确的结构




202407091142296979..png (28.99 KB, 下载次数 Times of downloads: 12)

202407091142296979..png

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-7-9 11:56:59 | 只看该作者 Only view this author
上图不是很清晰,上传了一个侧面的图

202407091156141971..png (23.42 KB, 下载次数 Times of downloads: 11)

202407091156141971..png

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发表于 Post on 2024-7-9 12:23:24 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 cokie 于 2024-7-9 12:34 编辑

猜测是你自旋多重度给的不对吧,你这个应该是Ni(II),最外层3d8,你可能得把多重度为1和为3的都算一下,看一下哪个能量低。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-7-9 13:19:34 | 只看该作者 Only view this author
cokie 发表于 2024-7-9 12:23
猜测是你自旋多重度给的不对吧,你这个应该是Ni(II),最外层3d8,你可能得把多重度为1和为3的都算一下,看 ...

刚才按照您的建议用0 3又提交了一遍任务,结构还是和之前一样Br-Ni-Br变直线结构了

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发表于 Post on 2024-7-9 15:29:24 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 北羊羽羽 于 2024-7-9 15:31 编辑

Gen may be used in a completely analogous way to specify an alternate density fitting basis set.

The GenECP variation may be used to read in both basis functions and ECPs; it is equivalent to Gen Pseudo=Read.

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-7-9 18:26:03 | 只看该作者 Only view this author
北羊羽羽 发表于 2024-7-9 15:29
Gen may be used in a completely analogous way to specify an alternate density fitting basis set.

...

多谢提醒,确实没有用GENECP定义赝势基组。重新提交任务之后Ni的配位为平面结构,与实际上的四面体配位仍然会有偏差

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发表于 Post on 2024-7-9 22:03:06 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 cokie 于 2024-7-9 22:19 编辑

本身Ni(II)如果想正四面体,那就是3d8排布,sp3杂化,此时多重度是3;如果多重度是1,是dsp2杂化,四边形配位

dimine-L3-19.zip

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-7-10 17:33:36 | 只看该作者 Only view this author
cokie 发表于 2024-7-9 22:03
本身Ni(II)如果想正四面体,那就是3d8排布,sp3杂化,此时多重度是3;如果多重度是1,是dsp2杂化,四边形配 ...

非常感谢!终于解决了!

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发表于 Post on 2024-8-1 13:01:56 | 只看该作者 Only view this author
squirrelS 发表于 2024-7-10 17:33
非常感谢!终于解决了!

你好,有关于金属配合物OER的相关问题想请教一下您

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