计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 533|回复 Reply: 6
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[新手求助] 请教如何解决用TS找过渡态无法收敛的问题

[复制链接 Copy URL]

12

帖子

0

威望

61

eV
积分
73

Level 2 能力者



各位前辈好,我用TS方法计算过渡态,出现报错,原因是 Optimization stopped. -- Number of steps exceeded,  NStep= 288-- Flag reset to prevent archiving.根据站上的指导,优化时能量的变化曲线,发现震荡不大

这是一个花生四烯酸和单线态氧反应过程的过渡态计算
后来我尝试把上边最后的结构保存,用calcall计算opt=(calcall,ts,noeigen) freq b3lyp/6-31g(d,p),可以正常结束但是得到的能量曲线如下,并且没有虚频,无法正确找到过渡态

不好意思,量子化学不是很懂,刚刚开始学习,希望能够得到指点。

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112354

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2024-7-30 21:35:18 | 只看该作者 Only view this author
99%的原因是过渡态初猜不合适。没具体输入文件也没法做更多判断
参考
简谈Gaussian里找过渡态的关键词opt=TS和QST2、3
http://sobereva.com/460http://bbs.keinsci.com/thread-12093-1-1.html

震荡不大”明显是误解。你把末期曲线放大了看,绝对震荡明显



另外,当前分子内色散作用对构象影响明显,最好带上D3校正
DFT-D色散校正的使用
http://sobereva.com/210
谈谈“计算时是否需要加DFT-D3色散校正?”
http://sobereva.com/413


北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

12

帖子

0

威望

61

eV
积分
73

Level 2 能力者

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-7-30 22:06:40 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-7-30 21:35
99%的原因是过渡态初猜不合适。没具体输入文件也没法做更多判断
参考
简谈Gaussian里找过渡态的关键词opt ...


谢谢老师回复,这个是后边放大之后的曲线,然后下边是输入文件
%chk=C:\Users\H\Desktop\C20H32O2.chk
# opt=(calcfc,ts,noeigen) freq=noraman b3lyp/6-31g(d,p)

Title Card Required

0 2
O                 -5.73949200    4.44270200   -1.64318800
O                 -5.75147200    4.26119600    0.57747600
C                  5.35108000    1.41612800    0.72893600
C                  6.82107800    1.73954700    0.41626900
C                  5.05884100   -0.08615700    0.94229900
C                  7.07271300    3.24936100    0.27857100
C                  5.41325100   -0.95195400   -0.24323600
C                  8.53846300    3.57620800   -0.03387400
C                 -5.20717200    1.44597500    0.53676600
C                 -4.55621800    0.07083000    0.34392700
C                  4.70110600   -1.97439100   -0.73186300
C                  3.38414800   -2.50098400   -0.20652500
C                 -4.90399600    2.36306900   -0.65617900
C                 -4.71549600   -0.88516600    1.50183200
C                 -2.64440200   -2.27750200    1.02994800
C                  2.41444600   -2.81019200   -1.32864200
C                 -3.84082300   -1.85346500    1.81141900
C                  0.24770100   -2.32658800   -0.08433600
C                  1.08075100   -2.72348400   -1.28236800
C                 -2.10377300   -1.33166100    0.00518100
C                 -0.85502300   -1.36708900   -0.47165000
C                 -5.49590100    3.75895100   -0.48798400
H                 -5.22582800    4.06162900   -2.36954800
H                  4.72056200    1.78736800   -0.08710600
H                  5.06382800    1.95189100    1.64071700
H                  7.11903600    1.24957800   -0.51688900
H                  7.45684900    1.34146800    1.21709300
H                  3.99652700   -0.20239700    1.17667600
H                  5.62409700   -0.42892200    1.81963500
H                  6.78107300    3.74780900    1.21019300
H                  6.43499700    3.64644500   -0.51955300
H                  6.35092000   -0.71732500   -0.74158100
H                  8.69311300    4.65456400   -0.12765700
H                  9.19862600    3.21023300    0.75834300
H                  8.85229200    3.10939800   -0.97250100
H                 -4.82501800    1.91844600    1.44469600
H                 -6.29027400    1.34056200    0.65128300
H                 -3.48436800    0.14808300    0.24426300
H                 -4.94952800   -0.40084500   -0.56633600
H                  5.09485100   -2.49784800   -1.60204000
H                  2.94196000   -1.78571200    0.49095400
H                  3.57462900   -3.42292800    0.36312100
H                 -5.27588500    1.92009400   -1.58646700
H                 -3.81685800    2.47655100   -0.75847200
H                 -5.59412700   -0.76836100    2.13296600
H                 -1.92894600   -2.89077900    1.57000400
H                  2.86689700   -3.12988100   -2.26555100
H                 -4.02844400   -2.44472500    2.70324700
H                  0.88041400   -1.86358300    0.67998400
H                 -0.18752500   -3.22655500    0.36062800
H                  0.51771600   -2.96526300   -2.18129700
H                 -2.79348700   -0.59361000   -0.36669100
H                 -0.58485000   -0.64039800   -1.23671200
O                 -2.88173400   -3.73374200   -1.00283100
O                 -3.34578800   -3.44185600    0.19650000



5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112354

管理员

公社社长

4#
发表于 Post on 2024-7-30 22:15:14 | 只看该作者 Only view this author
你那个根本不是花生四烯酸,C15少了氢。如果是自由基需要说清楚

甭写毫无意义的noraman,仔细看
常见的多余的和被滥用的Gaussian关键词
http://sobereva.com/331http://bbs.keinsci.com/thread-3460-1-1.html

放大得还不够
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

12

帖子

0

威望

61

eV
积分
73

Level 2 能力者

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-7-31 09:16:32 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 scott__ 于 2024-7-31 09:26 编辑
sobereva 发表于 2024-7-30 22:15
你那个根本不是花生四烯酸,C15少了氢。如果是自由基需要说清楚

甭写毫无意义的noraman,仔细看

嗯嗯,谢谢老师,我去学习一下,改正一下我的关键词使用。

老师,这个我是初学者,好像不太理解怎样是震荡明显,我看着好像后边五个点的值一样,然后跟前一个点差0.000002。

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112354

管理员

公社社长

6#
发表于 Post on 2024-8-1 01:20:10 | 只看该作者 Only view this author
scott__ 发表于 2024-7-31 09:16
嗯嗯,谢谢老师,我去学习一下,改正一下我的关键词使用。

老师,这个我是初学者,好像不太理解怎样是 ...

看out文件里面的四个优化收敛的判据的变化情况
总能量不是收敛判据
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

12

帖子

0

威望

61

eV
积分
73

Level 2 能力者

7#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-8-1 10:34:47 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-8-1 01:20
看out文件里面的四个优化收敛的判据的变化情况
总能量不是收敛判据

嗯嗯,谢谢老师

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-24 04:08 , Processed in 0.171569 second(s), 24 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list