做聚合物模渗透模拟时gmx_rdf 图像没有归一且峰值很大

chenyuhan · 发表于 Post on 2024-7-31 19:49:10

本帖最后由 chenyuhan 于 2024-8-20 10:48 编辑

删除或者隐藏这个帖子，谢谢您

龙之吐息 · 发表于 Post on 2024-7-31 20:51:12

RDF的定义是计算距离参考点半径为r+Δr处壳层内目标粒子的出现概率，显然你的体系是一个非均质体系，自然可能会不收敛到1，我记得sob老师有在别的帖子回复过说对于膜体系可能考虑膜法向方向目标粒子的分布更合理。

chenyuhan · 发表于 Post on 2024-8-1 12:29:56

龙之吐息发表于 2024-7-31 20:51
RDF的定义是计算距离参考点半径为r+Δr处壳层内目标粒子的出现概率，显然你的体系是一个非均质体系，自然可 ...

原来是这样，我先去试一试，谢谢您的解答，太感谢了

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[GROMACS] 做聚合物模渗透模拟时gmx_rdf 图像没有归一且峰值很大