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[综合交流] 如何求非平衡构象的boltzmann分布?

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sob有篇讲boltzmann分布的:
“根据Boltzmann分布计算分子不同构象所占比例http://sobereva.com/165
其中sob讲到:
"需要说明的是,前面所谓的构象的能量是指自由能。所以,必须先优化到相应构象结构,计算电子能量,再做振动分析,把热力学校正能加上去得到自由能"

现在我有一个体系。涉及到单键的旋转,比如:
我想知道这个二面角在不同角度的boltzmann分布。
问题是只有一个二面角比如35度下,才是能量最低点,如果在其他二面角下进行构象优化。都会回到35度的能量最低点。
那么应该如何获得其他二面角下的自由能呢?


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2#
发表于 Post on 2016-12-21 14:12:33 | 只看该作者 Only view this author
通过极小点的自由能计算boltzmann分布比率是对于极小点而言的,对于非极小点没法做这种计算
非要去得到不同二面角的比例的话,那就做动力学模拟,从轨迹上统计处在不同二面角的比率
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