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楼主 Author: ZetaFunction
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[ORCA] 对比ORCA6.0和Gaussian16的几何优化算法

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发表于 Post on 2024-8-5 01:10:23 | 只看该作者 Only view this author
ZetaFunction 发表于 2024-8-4 11:57
我之前就一直好奇ONIOM如果考虑静电嵌入的话梯度要怎么处理,因为高层的能量不再是和低层坐标无关的函数 ...

感谢反馈,我跟我们这边负责QM/MM的人说一下
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?hl=zh-CN&user=XW6C6eQAAAAJ&view_op=list_works&sortby=pubdate
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1034/1702.htm
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发表于 Post on 2024-8-5 01:11:08 | 只看该作者 Only view this author
ZetaFunction 发表于 2024-8-4 12:58
频率算完了,Gaussian所优化的结构确实有一个-9的小虚频,当前计算级别下算一次频率要三个小时。ORCA所优 ...

可以实际试试用高斯的结构消虚频,看看迭代多少步。结构差异小未必代表迭代次数少
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?hl=zh-CN&user=XW6C6eQAAAAJ&view_op=list_works&sortby=pubdate
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-8-5 03:21:23 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2024-8-5 01:11
可以实际试试用高斯的结构消虚频,看看迭代多少步。结构差异小未必代表迭代次数少

ORCA不仅在优化的末尾截断需要迭代明显更多的次数,而且在优化的起始截断能量下降速度也明显比Gaussian慢。如果确实是由于虚频引起的,可以在优化的前几步先不考虑虚频,以能量最快下降为优先,等到几何结构变化很微小之后再考虑消除虚频,类比用Gaussian优化过渡态结构时总是推荐先写上noeigentest。也许这样处理优化效率会更高?

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发表于 Post on 2024-12-19 16:04:56 | 只看该作者 Only view this author
最近刚用orca 优化结构。 151个原子, 无重原子, orca600明显比orca504快, 相同墙钟时间,两个相同机器,orca600优化了136圈, orca504只做了32圈。 orca504 慢的问题在于自洽场迭代有问题, 能量不总是下降。
orca600 每个优化步骤明显比gaussian09时间短,至于是否需要比gaussian09更多的优化步骤, 因为guassian09 没继续做, 不知道。
  
欲士不遗于野,难矣。

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发表于 Post on 2024-12-19 16:10:59 | 只看该作者 Only view this author
补充一下: 优化的结构部分有柔性, Gaussian09和orca600对这部分的优化走向明显不同,将导致不同的最终结构。初始结构先g09小基组优化未完全收敛。
欲士不遗于野,难矣。

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发表于 Post on 2025-6-13 10:42:03 | 只看该作者 Only view this author
ORCA有windows版本吗?

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发表于 Post on 2025-6-13 10:59:07 | 只看该作者 Only view this author
glacierpan 发表于 2025-6-13 10:42
ORCA有windows版本吗?

有,在orca论坛下载区可以看到
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
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ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1034/1702.htm
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