计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 399|回复 Reply: 6
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[Molclus] 求助使用molclus 1.12的isostat对traj.xyz能量排序报错

[复制链接 Copy URL]

13

帖子

0

威望

89

eV
积分
102

Level 2 能力者

本帖最后由 wgl 于 2024-8-23 09:04 编辑

操作流程:
1.genmer生成10个二聚体分子
2.molclus+MOPAC做初步优化
3.运行./isostat
4.输入几何阈值时,出现了报错

屏幕截图 2024-08-23 084148.png (51.59 KB, 下载次数 Times of downloads: 5)

屏幕截图 2024-08-23 084148.png

traj.xyz

41.46 KB, 下载次数 Times of downloads: 6

33

帖子

0

威望

1252

eV
积分
1285

Level 4 (黑子)

2#
发表于 Post on 2024-8-23 08:51:08 | 只看该作者 Only view this author
traj.xyz没有能量

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112543

管理员

公社社长

3#
发表于 Post on 2024-8-23 08:59:14 | 只看该作者 Only view this author
不要自己在标题里手写[molclus]这种标签。这次给你删了,以后注意
你没上传isostat读取的isomers.xyz,没法判断情况
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

13

帖子

0

威望

89

eV
积分
102

Level 2 能力者

4#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-8-23 09:02:44 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-8-23 08:59
不要自己在标题里手写[molclus]这种标签。这次给你删了,以后注意
你没上传isostat读取的isomers.xyz,没 ...

好的,谢谢老师

13

帖子

0

威望

89

eV
积分
102

Level 2 能力者

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-8-23 09:05:52 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-8-23 08:59
不要自己在标题里手写[molclus]这种标签。这次给你删了,以后注意
你没上传isostat读取的isomers.xyz,没 ...

老师,我看了isostat读取的isomers.xyz,是空白文件,是什么情况呀

13

帖子

0

威望

89

eV
积分
102

Level 2 能力者

6#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-8-23 09:06:24 | 只看该作者 Only view this author
lilf 发表于 2024-8-23 08:51
traj.xyz没有能量

请问这步的能量从哪里获取呀

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112543

管理员

公社社长

7#
发表于 Post on 2024-8-23 09:45:23 | 只看该作者 Only view this author
wgl 发表于 2024-8-23 09:05
老师,我看了isostat读取的isomers.xyz,是空白文件,是什么情况呀

仔细看molclus运行过程中的所有提示,根据提示解决
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-27 17:55 , Processed in 0.184355 second(s), 24 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list