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[GROMACS] 求助:Gromacs模拟Zn金属和电解液的界面快照

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各位老师,我利用Gromacs模拟锌金属和电解液的界面得到如下快照,为什么最后在界面处明显看到电解液出现分布不均的现象啊(如图框中所示)

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发表于 Post on 2024-9-12 17:23:22 | 只看该作者 Only view this author
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-9-12 17:57:36 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-9-12 17:23
体现了液体与表面的相互作用特征

谢谢老师回复,那在模拟过程中这个是正常对吗?

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发表于 Post on 2024-9-12 20:41:31 | 只看该作者 Only view this author
请问能否分享下em和prod的.mdp文件,我在模拟固液界面能量最小化的时候一直无法收敛

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发表于 Post on 2024-9-13 02:22:28 | 只看该作者 Only view this author
xjw 发表于 2024-9-12 17:57
谢谢老师回复,那在模拟过程中这个是正常对吗?

正常
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-11-8 20:47:05 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 xjw 于 2024-11-8 20:50 编辑

老师您好,我在做界面模拟的时候,做了加正向电压和反向电压以及不加电压三种情况,但是这三种情况计算出来的分子在z轴上的密度分布相差很小,如下图1,这个情况正常吗?我本来想的是加不同方向电压带电荷的离子分布具有较大的差异,我在文献中看到有较大差异如图2

202411082046544309..png (30.96 KB, 下载次数 Times of downloads: 0)

图1

图1

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