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楼主 Author: 飞翔的胖吉
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[Sobtop] Sobtop构建Ti3C2拓扑文件时遇到力常数为0且em自动终止怎么解决?

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发表于 Post on 2024-11-29 10:43:47 | 只看该作者 Only view this author
sissiAC 发表于 2024-11-28 14:57
请问itp文件里为什么会有Ti-Ti键呢?看Ti3C2结构应该没有吧,你最终问题解决了吗

依靠距离判断成键就会这样,Ti-Ti距离很近,用MOL2文件,删除这个键

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 楼主 Author| 发表于 Post on 4 day ago | 只看该作者 Only view this author
thor 发表于 2024-11-29 10:43
依靠距离判断成键就会这样,Ti-Ti距离很近,用MOL2文件,删除这个键

可以通过调节sobtop中的bondscrip文件来判断成键

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