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[综合交流] 说说自己最近优化结构遇到的头大的事情

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楼主
G16,b3lyp,def2svp,gd3,PCM溶剂化,125个原子,540个电子,过渡态一次优化非常顺利结束。
从过渡态虚频震动方向的结构作为初始结构计算中间体INT1,开始优化,脚本设置6小时杀掉。看结果,在第20+个点的时候两个力YES,RMS位移YES,Maximum位移NO,结构是想要的INT1结构,虽然后续的点YES全消失了,但是不影响开心的心情;
然而之后心态崩溃开始了:
1.取该三个YES的结构做一个输入文件A,加上maxstep=5,notrust,优化6小时,能量基本不变,四个参数的YES却全部消失;
2.继续把最后一个结构做成输入文件B,继续优化6小时,仍然没有一个YES;
3.输入文件A中加上int=ultrafine,做成输入文件C,优化12小时,能量稳定,没有YES;
4.输入文件A中加上opt=gdiis,calcfc做成输入文件D,优化6小时,能量稳定,没有YES;
5.取三个YES的结构并且不改变命令,继续优化24小时,消失的YES并未出现;
5.取已经优化完成的INT2的结构(该结构不到12小时就opt+freq结束),将H换成Cl,做成INT1的初始结构文件,优化12小时,两个力参数YES,但是不收敛,重复步骤1的maxstep=5,notrust,YES仍然消失;
6.取过渡态柔性扫描曲线最低点结构优化,得到两个力参数的YES后消失,再也没有出现YES;
7.作为有强迫症的人,努力说服自己,用自己向来都不喜欢的opt=loose,成功收敛,一看频率,崩溃,一个-700+的大虚频!

从在老师那里学计算开始也几年了,第一次遇到这么难优化的结构。现在已经走上最后一条路了,opt=tight,打算拼48小时的机时,如果这次再优化不好,就努力压制自己的强迫症,彻底放弃这个结构了

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吃猫咪的鱼

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发表于 Post on 2024-10-24 14:05:31 | 只看该作者 Only view this author
如果卢老师的几何优化不收敛中所有的做法都尝试了,比如减少步长或者使用opt=calcall关键词等,可以尝试把溶剂模型先去掉再试试。有时候一些体系优化到后面经常出现无规律的波动很难收敛,可能是溶剂模型的噪音导致的。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-10-24 15:47:36 | 只看该作者 Only view this author
imasen 发表于 2024-10-24 14:05
如果卢老师的几何优化不收敛中所有的做法都尝试了,比如减少步长或者使用opt=calcall关键词等,可以尝试把 ...

我也在卢老师的链接里面看到了溶剂模型的影响。不过我那个是优化的能量基本都没有波动的变化,所以就没尝试。不过我感觉的确值得去掉溶剂模型试试

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-10-25 09:14:22 | 只看该作者 Only view this author
imasen 发表于 2024-10-24 14:05
如果卢老师的几何优化不收敛中所有的做法都尝试了,比如减少步长或者使用opt=calcall关键词等,可以尝试把 ...

老铁,我试了试不使用溶剂化,果然很快就收敛了,太给力了!真是有点震惊,卢老师327链接里的内容尝试了那么多,最后是没有尝试的溶剂化的问题。不过我把没有溶剂化的结构加上溶剂化,YES又跑没了。不过已经很好了,看到结构收敛的希望了

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