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[Material Studio] MS的cif文件 点击 计算成键为什么还会有未成键的原子 MOF

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如图是NH2-MIL-125(Ti)的cif文件,导入到MS中点击计算成键,仍然有红色未成键的氧原子是为什么

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发表于 Post on 2024-10-30 08:20:36 | 只看该作者 Only view this author
图显示的成不成键都未必是真实成键,是否真正成键,要看键级分析,如果想显示更多,可以把键长阈值设大一点,我一般设为默认值的1.4倍左右

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-10-30 13:11:26 | 只看该作者 Only view this author
aaq2800 发表于 2024-10-30 08:20
图显示的成不成键都未必是真实成键,是否真正成键,要看键级分析,如果想显示更多,可以把键长阈值设大一点 ...

明白谢谢老师

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发表于 Post on 2024-10-30 13:50:41 | 只看该作者 Only view this author
MS里计算键不一定对的,你可以手动连。然后你苯环链接也不对,应该是有晶体学无序,应该一个苯环上只有一个NH2

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发表于 Post on 2024-10-30 20:44:33 | 只看该作者 Only view this author
这个可以自己连起来吧我记得

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发表于 Post on 2024-10-31 08:11:41 | 只看该作者 Only view this author
对,为了看起来漂亮,可以手动把任意2个原子连接起来,先点一下那个 C,然后点一个原子,就是出现所谓的键,可以拉向任意一个原子,然后连接起来

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-10-31 13:47:52 | 只看该作者 Only view this author
John_Tao 发表于 2024-10-30 13:50
MS里计算键不一定对的,你可以手动连。然后你苯环链接也不对,应该是有晶体学无序,应该一个苯环上只有一个 ...

哦哦 明白了 他计算成键错了 谢谢老师

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