密度泛函计算结合能如何做应用？

ynzhou · 发表于 Post on 2024-12-28 17:09:12

本帖最后由 ynzhou 于 2024-12-28 17:38 编辑

想用密度泛函方法做一些应用，关于计算氨基酸残基对之间的相互作用能量，请问大家有什么建议吗？目前的想法是计算某种蛋白受体与各种活性多肽之间的相互作用能量，希望各位老师可以给点建议！

wzkchem5 · 发表于 Post on 2024-12-28 17:44:28

与其用DFT，不如用高端一点的方法，比如LED，入门门槛是一致的，但是能发的文章好很多

ynzhou · 发表于 Post on 2024-12-28 17:48:58

wzkchem5 发表于 2024-12-28 17:44
与其用DFT，不如用高端一点的方法，比如LED，入门门槛是一致的，但是能发的文章好很多

因为是课题组内发展的一个泛函，所以想做一点应用？请问老师有什么建议吗？

wzkchem5 · 发表于 Post on 2024-12-28 18:52:32

ynzhou 发表于 2024-12-28 10:48
因为是课题组内发展的一个泛函，所以想做一点应用？请问老师有什么建议吗？

这样的话，得看你们的泛函在哪些方面有特殊设计了，最好是算的体系能体现出你们设计思路的优势。比如如果你们泛函的SIE小，可以算大共轭自由基之间的非共价结合能，或者过渡金属配合物（包括金属酶的活性中心）之间的非共价结合能。至于常见闭壳层有机分子的相互作用能，我感觉通过理性设计改善精度已经做到头了，再想做得准得靠机器学习了

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[综合交流] 密度泛函计算结合能如何做应用？

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