amber导入小分子力场时出错

现在就好 · 发表于 Post on 2017-2-21 09:07:35

1、我在用amber导入蛋白质的时候先导入了小分子的.prep .frcmod文件，然后在导入蛋白质的时候出现了这样的错误，并且跳出了tleap。这是怎么回事呢？请老师帮一下忙，谢谢了。2、是因为原子类型不一致吗？原子类型和什么比较呢？
3、导入的小分子力场个数有限制吗？

谢谢老师，麻烦老师了

abdoman · 发表于 Post on 2017-2-21 11:41:13

应该是你pdb文件，与分子参数文件prep 文件，分子顺序不一致吧。

现在就好 · 发表于 Post on 2017-2-21 16:27:04

abdoman 发表于 2017-2-21 11:41
应该是你pdb文件，与分子参数文件prep 文件，分子顺序不一致吧。

这样啊谢谢您那应该怎样改呢？对照着prep文件把我的pdb文件整个都调成与prep文件一致的原子顺序吗？

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[Amber] amber导入小分子力场时出错