SH基活化CH键时过渡态有时算的出有时算不出，求教怎么调整

王小凡 · 发表于 Post on 2017-3-3 09:41:08

计算SH自由基活化有机分子片段上C-H键的时候，热力学计算CH键BDE能量都很低几乎没差，但是有的能算出来H在C、S原子间振动的过渡态结果，有的SH不能活化H键反而远离有机分子，该怎么调整算法？

成功的例子和失败的例子都添加在附件里，求帮助。

非常需要大家的帮助！

liyuanhe211 · 发表于 Post on 2017-3-3 10:28:58

初猜不太好，有的自由基反应过渡态对初猜比较敏感。经验上可以尝试将C-H键键长调整到1.3A，S-H键键长调整到1.7A左右尝试。如果仍然不行，可以将这两个键长锁定后做限制性优化，得到的结构再做过渡态搜索。还仍然不行就柔性扫描S-H键键长。

王小凡 · 发表于 Post on 2017-3-3 11:12:02

liyuanhe211 发表于 2017-3-3 10:28
初猜不太好，有的自由基反应过渡态对初猜比较敏感。经验上可以尝试将C-H键键长调整到1.3A，S-H键键长调整到 ...

非常感谢！如果还有问题再来问，真的非常感谢！

王小凡 · 发表于 Post on 2017-3-3 11:13:51

liyuanhe211 发表于 2017-3-3 10:28
初猜不太好，有的自由基反应过渡态对初猜比较敏感。经验上可以尝试将C-H键键长调整到1.3A，S-H键键长调整到 ...

想问层主，C-H-S的角度依旧保持180度就可以么？

liyuanhe211 · 发表于 Post on 2017-3-3 11:19:05

王小凡发表于 2017-3-3 11:13
想问层主，C-H-S的角度依旧保持180度就可以么？

可以先这么试，一般自由基HAT的过渡态都比较直。不放心也可以做限制性优化。

王小凡 · 发表于 Post on 2017-5-17 15:05:09

liyuanhe211 发表于 2017-3-3 11:19
可以先这么试，一般自由基HAT的过渡态都比较直。不放心也可以做限制性优化。

您好，在上次的指导下我算出了大部分数据，但是还是会出现有的分子跑掉的问题，我进行限制性优化的时候原子却还是跑掉了，求问该怎么解决呢？谢谢。

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