[综合交流] charmm-gui构建膜蛋白结构蛋白比较大，膜选多大合适呢

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NEW12138

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发表于 Post on 2025-3-6 22:33:21 | 只看该作者 Only view this author 回帖奖励

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本帖最后由 NEW12138 于 2025-3-6 22:34 编辑

如题，发现蛋白太大了，我构建的时候选的11*11 nm2的xy平面都只能将将好把蛋白包住。感觉流出空间给分子相互作用（本人是想做嵌膜分子和膜蛋白的作用，此分子不进入膜蛋白孔隙）至少得15*15 nm了，找参考文献没写膜多大，只说了个总原子数量126000，好大啊！感觉要算好久！是我太吝啬计算资源了还是确实有点大了，以前做的膜体系都是8*8左右，这是第一次做膜蛋白模拟，所以想请教一下各位老师

本主题由 sobereva 于 2025-3-7 06:24 分类

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