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[CASTEP/Dmol3/MS] 求助准备进一步几何优化前,石墨烯衬底模型出现自动变化

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图一是已经完成几何优化的石墨烯模型,我的目的是在优化好的石墨烯上加上四个钛原子后(如图二)再进一步的去几何优化。但是为什么当我把四个钛原子放到优化好的石墨烯上面,图一的石墨烯衬底就自动变化了呢,感觉像变成了没任何优化前的石墨烯超晶胞。我可以对这样自动变化的图2模型进行再一步的优化嘛?希望有懂的老师可以帮忙解答一下。谢谢!

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发表于 Post on 2025-3-9 22:27:18 | 只看该作者 Only view this author
一律截图,不要拍照,第一张图占了服务器多达1.11 MB空间,而截图的话也就占两百KB,而且拍照拍出来得还很难看
此帖专门强调了
网上求助时尽量不要拍照屏幕提问  http://bbs.keinsci.com/thread-5914-1-1.html
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-3-10 21:48:16 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-3-9 22:27
一律截图,不要拍照,第一张图占了服务器多达1.11 MB空间,而截图的话也就占两百KB,而且拍照拍出来得还很 ...

好的,抱歉。

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发表于 Post on 2025-3-11 04:01:12 | 只看该作者 Only view this author
我不用M$,但我没看出衬底有什么问题。对于边界原子的显示,可视化程序普遍有特定的判断规则(边界原子与晶胞边缘的距离),第一张图没显示边界的镜像原子,第二张图可能由于负载后坐标发生了轻微变化,恰巧导致显示出了镜像原子。实际上衬底原子的坐标并没什么变化。没什么可担心的。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-3-17 10:51:03 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-3-11 04:01
我不用M$,但我没看出衬底有什么问题。对于边界原子的显示,可视化程序普遍有特定的判断规则(边界原子与晶 ...

感谢老师的回复,谢谢

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