求助，gromacs计算气液表面活性剂体系，表面张力过高

1076005085 · 发表于 Post on 2025-3-11 18:49:10

老师们好，我在复现别人的表面活性剂体系的时候，各种参数都按照论文里面写的参数来设置，但是得不到论文中的表面张力的数值，表面张力过高，建模方式为pacakmol建模，三明治结构，如图所示，计算出来的表面张力用卢老师给的公式进行计算，水模型采用spce力场，co2采用EMP2力场，表面活性剂用charmm-gui得到的charmm36力场，能量最小化后，npt计算时间为5ns, md计算时间为50ns, 然而我计算出来的表面张力为20多mN/m,论文里面的结果为6.5左右mN/m，也尝试过修改一些参数，但是得到的结果都是差不多20mN/m，请问是哪里设置的不对导致这个原因的呢？附上mdp文件和top文件。
万分感谢！

1076005085 · 发表于 Post on 2025-4-8 21:14:32

已经解决

		自动登录 Automatic login	找回密码 Forget password
密码 Password			注册 Register

[GROMACS] 求助，gromacs计算气液表面活性剂体系，表面张力过高

浏览过的版块