想请教一下大佬们跑完nvt系综后，SiO2狭缝发生了滑移是怎么回事？

sssyyuan · 发表于 Post on 2025-3-12 21:04:49

想请教一下，本人在用nvt对SiO2狭缝中的液体进行控温反应，跑完之后发现SiO2发生了滑移？但是导入轨迹文件发现是完整的，于是我用trjconv截取了最后一帧作为gro文件，进而用packmol重新建模，剪完模后，在能量最小化的时候发生了报错。

sssyyuan · 发表于 Post on 2025-3-19 15:07:17

已解决

aljj · 发表于 Post on 2025-9-29 16:03:18

可以请问你sio2的itp文件是哪个力场的参数吗，怎么生成呢

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[GROMACS] 想请教一下大佬们跑完nvt系综后，SiO2狭缝发生了滑移是怎么回事？