请教脂质体囊泡力场适配问题

230820071 · 发表于 Post on 2025-3-29 18:28:22

我先使用insane构建了一个DPPC的脂质体双分子层，然后使用bumpy构建成囊泡，但是添加任何与脂质体相关的力场时都在报错，一直识别不出NC3，具体如下
“Atom NC3 in residue DPPC 1 was not found in rtp entry DPPC with 130 atoms while sorting atoms.”想请教各位老师如何解决

student0618 · 发表于 Post on 2025-3-29 21:57:05

rtp中该原子是什么名字？

230820071 · 发表于 Post on 2025-3-29 22:08:41

student0618 发表于 2025-3-29 21:57
rtp中该原子是什么名字？

原子是N。是这样的，我还看到有说insane做出来的就是martini粗粒化过的，会不会和这个有关？另外，想问一下怎么做出完全封闭的囊泡

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