计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 17454|回复 Reply: 18
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[新手求助] 过渡态优化SCF不收敛

[复制链接 Copy URL]

588

帖子

0

威望

3310

eV
积分
3898

Level 5 (御坂)

本帖最后由 xujian 于 2017-3-10 11:06 编辑

在B3LYP/Def2-TZVPP水平下得到的过渡态,用CB3-QB3优化,出现SCF不收敛的问题(L502,Convergence failure),尝试过SCF(novaracc,noincfock) int=acc2e=12,SCF=vshift=500,以及用B3LYP的波函数做初猜,guess=read。也直接用CBS-QB3优化好的反应物重新画过过渡态,但都不行,请问各位老师,有什么好的建议?

3097

帖子

29

威望

1万

eV
积分
17221

Level 6 (一方通行)

2#
发表于 Post on 2017-3-10 11:34:30 | 只看该作者 Only view this author
不保密的话上传输出文件看看

6万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
124671

管理员

公社社长

3#
发表于 Post on 2017-3-10 11:49:39 | 只看该作者 Only view this author
你是已经在B3LYP/Def2-TZVPP下找到了过渡态结构,然后又要用CBS-QB3继续优化过渡态并算出热力学数据?如果是这样,输入输出文件压缩后传上来
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

588

帖子

0

威望

3310

eV
积分
3898

Level 5 (御坂)

4#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-3-10 14:19:42 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-3-10 11:49
你是已经在B3LYP/Def2-TZVPP下找到了过渡态结构,然后又要用CBS-QB3继续优化过渡态并算出热力学数据?如果 ...

老师,附件中包含了B3LYP下正常结束的输出文件,以及CBS-QB3下用guess=read,以及上述关键词的输出文件,麻烦老师查看,谢谢
PhSOconformer3to5.rar (167.56 KB, 下载次数 Times of downloads: 69)

588

帖子

0

威望

3310

eV
积分
3898

Level 5 (御坂)

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-3-10 14:20:54 | 只看该作者 Only view this author
liyuanhe211 发表于 2017-3-10 11:34
不保密的话上传输出文件看看

谢谢老师,为了节约公社空间,我只上传在给sob老师的回复中了,麻烦查看,谢谢!

3097

帖子

29

威望

1万

eV
积分
17221

Level 6 (一方通行)

6#
发表于 Post on 2017-3-10 15:07:17 | 只看该作者 Only view this author
xujian 发表于 2017-3-10 14:20
谢谢老师,为了节约公社空间,我只上传在给sob老师的回复中了,麻烦查看,谢谢!

输入文件中应使用#p代替#来运行,这样可以显示SCF过程,否则像现在输出文件中具体的SCF信息根本没有。
应当重新带着#p运行文件,观察SCF收敛过程

在你的输出中(失败前)一共有4次成功的SCF,所需的循环数均甚多,可能该体系/构型就是不太容易SCF收敛,最后一次失败前也已收敛到1E-7的水平,故有可能遇到了少见的增加scf=maxcyc可以解决的问题,应带着#p观察最后一次scf过程是否却有收敛趋势,如果确实有,应当增加scf=maxcyc至某个大于128的数字,如scf=maxcyc=200,重新运行。如果没有收敛趋势另说。

  1.         Line 341:  SCF Done:  E(UB3LYP) =  -705.035390591     A.U. after  113 cycles
  2.         Line 1002:  SCF Done:  E(UB3LYP) =  -705.035740147     A.U. after   97 cycles
  3.         Line 1245:  SCF Done:  E(UB3LYP) =  -705.035851068     A.U. after   56 cycles
  4.         Line 1490:  SCF Done:  E(UB3LYP) =  -705.036179972     A.U. after   71 cycles
  5.         Line 1722:  SCF Done:  E(UB3LYP) =  -705.036288565     A.U. after  129 cycles
复制代码

评分 Rate

参与人数
Participants 1
eV +1 收起 理由
Reason
sobereva + 1

查看全部评分 View all ratings

3097

帖子

29

威望

1万

eV
积分
17221

Level 6 (一方通行)

7#
发表于 Post on 2017-3-10 15:23:01 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 liyuanhe211 于 2017-3-10 15:44 编辑
xujian 发表于 2017-3-10 14:20
谢谢老师,为了节约公社空间,我只上传在给sob老师的回复中了,麻烦查看,谢谢!

我自己跑了一下你的输入(→_→其实只是为了收集奇怪的错误),从右上角可以看出你的SCF却有收敛趋势,可以考虑从当前结构开始计算(如果当前结构合理),增加 SCF=maxcyc=N的数值(命令如SCF=(novaracc,noincfock,maxcyc=200))尝试,如果还不收敛,当前收敛结果也比较高了,稍微升高SCF收敛阈值也可以。



评分 Rate

参与人数
Participants 1
eV +1 收起 理由
Reason
sobereva + 1

查看全部评分 View all ratings

588

帖子

0

威望

3310

eV
积分
3898

Level 5 (御坂)

8#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-3-10 16:30:13 | 只看该作者 Only view this author
liyuanhe211 发表于 2017-3-10 15:07
输入文件中应使用#p代替#来运行,这样可以显示SCF过程,否则像现在输出文件中具体的SCF信息根本没有。
...

老师,我用#p计算过了,用scf=maxcyc=500,感觉SCF后能量第七位一直在变化,看不出是否具有收敛趋势
PhSOconformer3to5.log (865.71 KB, 下载次数 Times of downloads: 6)

588

帖子

0

威望

3310

eV
积分
3898

Level 5 (御坂)

9#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-3-10 16:31:04 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 xujian 于 2017-3-10 16:34 编辑
liyuanhe211 发表于 2017-3-10 15:23
我自己跑了一下你的输入(→_→其实只是为了收集奇怪的错误),从右上角可以看出你的SCF却有收敛趋势,可 ...

好的,我再试试,刚看到您的这条回复,可以忽略我上一条,也可以帮我看看

43

帖子

0

威望

1168

eV
积分
1211

Level 4 (黑子)

10#
发表于 Post on 2018-5-11 15:48:34 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 哈哈哈 于 2018-5-18 17:41 编辑
liyuanhe211 发表于 2017-3-10 15:07
输入文件中应使用#p代替#来运行,这样可以显示SCF过程,否则像现在输出文件中具体的SCF信息根本没有。
...

老师您好,我有些没看懂。麻烦您解答一下。就是您说 所需的循环数均甚多 是怎么来判定的多? #p 看收敛趋势 是怎么看,看四个收敛标准代表的值在下降? 麻烦您了。

31

帖子

0

威望

1123

eV
积分
1154

Level 4 (黑子)

11#
发表于 Post on 2020-10-26 09:20:49 | 只看该作者 Only view this author
liyuanhe211 发表于 2017-3-10 15:23
我自己跑了一下你的输入(→_→其实只是为了收集奇怪的错误),从右上角可以看出你的SCF却有收敛趋势,可 ...

老师您好,请问您使用的这个脚本有在论坛里发过吗?我只找到了tsmonitor。

1187

帖子

5

威望

2869

eV
积分
4156

Level 6 (一方通行)

12#
发表于 Post on 2020-10-26 10:47:50 | 只看该作者 Only view this author
hmlyz 发表于 2020-10-26 09:20
老师您好,请问您使用的这个脚本有在论坛里发过吗?我只找到了tsmonitor。

如果你只是想看SCF收敛曲线,用Multiwfn载入单点任务的out文件(输入文件必须有#P),进入主功能100的子功能6即可。

88

帖子

0

威望

233

eV
积分
321

Level 3 能力者

13#
发表于 Post on 2025-11-22 13:18:30 | 只看该作者 Only view this author
snljty 发表于 2020-10-26 10:47
如果你只是想看SCF收敛曲线,用Multiwfn载入单点任务的out文件(输入文件必须有#P),进入主功能100的子 ...

老师,您好,但是Multiwfn不是不能输入out文件吗

683

帖子

12

威望

2820

eV
积分
3743

Level 5 (御坂)

鸩羽

14#
发表于 Post on 2025-11-22 13:28:54 | 只看该作者 Only view this author
moiraaa 发表于 2025-11-22 13:18
老师,您好,但是Multiwfn不是不能输入out文件吗

其实你可以现场试一下的
某不知名实验组从苞米地里长出来的计算选手

88

帖子

0

威望

233

eV
积分
321

Level 3 能力者

15#
发表于 Post on 2025-11-22 14:04:29 | 只看该作者 Only view this author
wal 发表于 2025-11-22 13:28
其实你可以现场试一下的

我试了,但是程序直接退出了,我还去官网看了,好像不支持out文件诶

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-1-24 07:31 , Processed in 0.283153 second(s), 24 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list