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[CP2K] 使用CI-NEB方法搜索Li3N中Li离子迁移的过渡态,初末态能量发生了改变

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老师们,我在搜索Li3N中Li离子迁移的过渡态,构建了(3*3*2)的超胞,挖去两个相邻离子作为初末态并进行优化,然后使用CI-NEB方法搜索过渡态。按理来说初末态能量应该一样,但是问题在于在ener文件中初态能量不变,末态能量发生了增大,甚至高于中间过渡态。通过调整精度与结构优化一致后也还是这种结果。想请教老师们问题在哪儿,望不吝赐教。


我的初末态优化后xyz文件、几何优化与过渡态搜索inp与ener文件随附在下。
geo_opt.inp (1.2 KB, 下载次数 Times of downloads: 1)
band_1.inp (2.11 KB, 下载次数 Times of downloads: 4)
li3n.neb-1.ener (1.56 KB, 下载次数 Times of downloads: 1)
opt_end_1.xyz.txt (4.52 KB, 下载次数 Times of downloads: 4) opt_start_1.xyz.txt (4.52 KB, 下载次数 Times of downloads: 3)



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发表于 Post on 2025-4-18 11:27:33 | 只看该作者 Only view this author
找到问题所在了吗

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发表于 Post on 2025-4-23 15:32:21 | 只看该作者 Only view this author
末态能量一直是-575.87026没变。更后面位数轻微波动是并行运算带来的随机性所致。如果你指ener文件更后面的列,那是NEB点之间的间距。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-4-23 17:25:52 | 只看该作者 Only view this author
感谢老师们。我将ALIGN_FRAMES与ROTATE_FRAMES设为F后,末态能量和结构优化后的能量一致了,跑出的过渡态也比较正常。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-4-23 17:31:35 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-4-23 15:32
末态能量一直是-575.87026没变。更后面位数轻微波动是并行运算带来的随机性所致。如果你指ener文件更后面的 ...

老师,我这里表述有问题。我的意思是我对末态结构优化后能量为-575.87067,但在跑CI-NEB时能量变成了-575.87026,所以比较困惑。但把ALIGN_FRAMES与ROTATE_FRAMES设为F后,能量与结构优化一致了。

但我还是困惑什么时候应该将ALIGN_FRAMES与ROTATE_FRAMES关闭,还不太清楚这两项的意义,希望老师解答。

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发表于 Post on 2025-4-23 21:29:49 | 只看该作者 Only view this author
limpa 发表于 2025-4-23 17:31
老师,我这里表述有问题。我的意思是我对末态结构优化后能量为-575.87067,但在跑CI-NEB时能量变成了-575 ...


参考北京科音CP2K第一性原理计算培训班(http://www.keinsci.com/KFP)幻灯片

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