计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 19169|回复 Reply: 22
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[新手求助] 计算延迟荧光时的几个问题

[复制链接 Copy URL]

78

帖子

0

威望

260

eV
积分
338

Level 3 能力者

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
在计算延迟荧光时有几个问题不太明白,来请教大家几个问题:1.判断是否发生延迟荧光的条件是什么 ,难道只是看S1和T1之间的能差,还是从其他方面来判断,如速率?
  2.在计算分子时使用的方法为B3LYP/6-31G*,总是遇到能差特别小,但是从S1到S0的荧光速率也特别小,甚至有时计算光谱时S0到S1态的振子强度为0,和实验数据很不吻合,这是什么原因呐?
3.计算S1和T1态的重组能具体是怎么计算的,是这两个态的驰豫能之和吗,还是怎么来求?

8

帖子

0

威望

375

eV
积分
383

Level 3 能力者

2#
发表于 Post on 2017-3-22 10:03:44 | 只看该作者 Only view this author
1 *T Chen, L Zheng, J Yuan, Z An, R Chen, Y Tao, H Li, X Xie, W Huang: Understanding the Control of Singlet-Triplet Splitting for Organic Exciton Manipulating: A Combined Theoretical and Experimental Approach. Sci. Rep. 5 (2015) 10923.

这篇文献里给了一个TADF的能量差delE_ST < 0.37 eV 可以参考一下

2 不知道你算的是什么体系 可以先换个泛函试试 wB97xd M06-2X...

3 不太明白

1102

帖子

18

威望

6693

eV
积分
8155

Level 6 (一方通行)

計算化学の社畜

3#
发表于 Post on 2017-3-22 11:44:50 | 只看该作者 Only view this author
关于重组能的计算,参考《使用Dushin分解重组能和计算Huang-Rhys因子》http://sobereva.com/330
Stand on the shoulders of giants

78

帖子

0

威望

260

eV
积分
338

Level 3 能力者

4#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-3-22 15:01:04 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 阳光总在风雨后 于 2017-3-22 15:04 编辑
wq8484 发表于 2017-3-22 10:03
1 *T Chen, L Zheng, J Yuan, Z An, R Chen, Y Tao, H Li, X Xie, W Huang: Understanding the Control of  ...

非常感谢您的回复。  我在用使用optDFTw程序计算w时出现问题,输出文件中并没有W,不知道问题出在哪里,还望赐教。我的template.gjf文件命令:
%nproc=16
%mem=10GB
# LC-wPBE/6-31g*

Title Card Required

0 1
C                 -4.03012900    0.00111200    3.68588500
C                 -5.42274800    0.00117800    3.74075300
C                 -6.13931000    0.00082100    2.54714100
C                 -5.51871700    0.00040400    1.29098100
C                 -4.10858000    0.00036500    1.25067100
.....还望各位老师看到能给予帮助!

78

帖子

0

威望

260

eV
积分
338

Level 3 能力者

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-3-22 15:01:33 | 只看该作者 Only view this author
冰释之川 发表于 2017-3-22 11:44
关于重组能的计算,参考《使用Dushin分解重组能和计算Huang-Rhys因子》http://sobereva.com/330

感谢您的回复  很受用

1102

帖子

18

威望

6693

eV
积分
8155

Level 6 (一方通行)

計算化学の社畜

6#
发表于 Post on 2017-3-22 15:20:25 | 只看该作者 Only view this author
阳光总在风雨后 发表于 2017-3-22 15:01
非常感谢您的回复。  我在用使用optDFTw程序计算w时出现问题,输出文件中并没有W,不知道问题出在哪里, ...

等一整套流程走下来后,就会有一个关于w迭代的输出文件了
Stand on the shoulders of giants

78

帖子

0

威望

260

eV
积分
338

Level 3 能力者

7#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-3-22 15:40:38 | 只看该作者 Only view this author
冰释之川 发表于 2017-3-22 15:20
等一整套流程走下来后,就会有一个关于w迭代的输出文件了

最后输出template.log文件   但里面没有w的值 。我是先编辑好template.gjf文件   然后运行optDFTw  ,是哪里错了吗?

78

帖子

0

威望

260

eV
积分
338

Level 3 能力者

8#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-3-22 15:43:01 | 只看该作者 Only view this author
阳光总在风雨后 发表于 2017-3-22 15:40
最后输出template.log文件   但里面没有w的值 。我是先编辑好template.gjf文件   然后运行optDFTw  ,是 ...

脚本对这个计算有影响吗   是不是脚本缺东西。我贴出来您看下:
#! /bin/sh
#PBS -S /bin/bash
#PBS -N template.gjf                                                  
#PBS -j oe

# Envrionment setting for Gaussian09
#
#PBS -o ${PBS_JOBNAME}.err
#PBS -l nodes=node10:ppn=16
#PBS -V
JOBNAME=${PBS_JOBNAME}
### FOR Gauss09 #####
export g09root=/public/software/Gaussian09
DATE=`date +"%R-%F-%A"`
WHOAMI=`whoami`_${PBS_JOBID}_${DATE}
mkdir /tmp/${WHOAMI}
export GAUSS_SCRDIR=/tmp/$WHOAMI
. $g09root/g09/bsd/g09.profile
#
# End of envrionment setting for Gaussian09


cd ${PBS_O_WORKDIR}
/public/software/Gaussian09/g09/g09 < $JOBNAME > ${PBS_JOBNAME}.log

./optDFTw

1102

帖子

18

威望

6693

eV
积分
8155

Level 6 (一方通行)

計算化学の社畜

9#
发表于 Post on 2017-3-22 16:10:43 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 冰释之川 于 2017-3-22 16:11 编辑
阳光总在风雨后 发表于 2017-3-22 15:43
脚本对这个计算有影响吗   是不是脚本缺东西。我贴出来您看下:
#! /bin/sh
#PBS -S /bin/bash

相应地作业提交脚本也要修改:
---------------参考我们集群的脚本(运行optDFTw)-------------------
#!/bin/sh
#PBS -N Gaussian
#PBS -o job.log
#PBS -e err.log
#PBS -q yuan
#PBS -l nodes=1:ppn=4
#PBS -l walltime=1440:00:00
#PBS -j oe

mkdir -p /tmp/$PBS_JOBID
cp -r $PBS_O_WORKDIR/* /tmp/$PBS_JOBID
cd /tmp/$PBS_JOBID

optDFTw 0.002 0.2 0.0001   #optDFTw程序调用命令


cp -r /tmp/$PBS_JOBID/*  $PBS_O_WORKDIR
rm -rf /tmp/$PBS_JOBID

---------------------------------------------------------------------------

Stand on the shoulders of giants

78

帖子

0

威望

260

eV
积分
338

Level 3 能力者

10#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-3-22 17:09:50 | 只看该作者 Only view this author
冰释之川 发表于 2017-3-22 16:10
相应地作业提交脚本也要修改:
---------------参考我们集群的脚本(运行optDFTw)-------------------
...

好的  非常感谢 !

78

帖子

0

威望

260

eV
积分
338

Level 3 能力者

11#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-3-24 09:15:28 | 只看该作者 Only view this author
冰释之川 发表于 2017-3-22 16:10
相应地作业提交脚本也要修改:
---------------参考我们集群的脚本(运行optDFTw)-------------------
...

请问一下你的脚本里的 optDFTw 0.002 0.2 0.0001  这几个数字是固定的的吗?

1102

帖子

18

威望

6693

eV
积分
8155

Level 6 (一方通行)

計算化学の社畜

12#
发表于 Post on 2017-3-24 10:39:23 | 只看该作者 Only view this author
阳光总在风雨后 发表于 2017-3-24 09:15
请问一下你的脚本里的 optDFTw 0.002 0.2 0.0001  这几个数字是固定的的吗?

0.002 和 0.2 代表w扫描的范围是 [0.002,0.2]
0.0001代表的是w的精度(收敛限)
Stand on the shoulders of giants

78

帖子

0

威望

260

eV
积分
338

Level 3 能力者

13#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-3-24 11:22:19 | 只看该作者 Only view this author
冰释之川 发表于 2017-3-24 10:39
0.002 和 0.2 代表w扫描的范围是 [0.002,0.2]
0.0001代表的是w的精度(收敛限)

若果不设置就是默认的值   不设置也是可以的吗?我用的这个例子算了一下   出来的log文件里面没有w值,不知道问题出在哪里  请帮忙看一下

template.gjf.log

13.62 KB, 下载次数 Times of downloads: 2

template.gjf.gjf

300 Bytes, 下载次数 Times of downloads: 6

g09.pbs

795 Bytes, 下载次数 Times of downloads: 2

1102

帖子

18

威望

6693

eV
积分
8155

Level 6 (一方通行)

計算化学の社畜

14#
发表于 Post on 2017-3-24 13:07:13 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 冰释之川 于 2017-3-24 13:16 编辑
阳光总在风雨后 发表于 2017-3-24 11:22
若果不设置就是默认的值   不设置也是可以的吗?我用的这个例子算了一下   出来的log文件里面没有w值,不 ...

可以不设置这些参数。你作业提交脚本不对,我做了相应的修改(见附件),你再试试看。 g09.pbs (667 Bytes, 下载次数 Times of downloads: 11)

Stand on the shoulders of giants

78

帖子

0

威望

260

eV
积分
338

Level 3 能力者

15#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-3-24 16:52:36 | 只看该作者 Only view this author
冰释之川 发表于 2017-3-24 13:07
可以不设置这些参数。你作业提交脚本不对,我做了相应的修改(见附件),你再试试看。

好的 ,非常感谢!

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2025-8-18 02:31 , Processed in 0.232884 second(s), 23 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list