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[GROMACS] LiFP6+EC小盒子体系NPT模拟崩溃

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楼主
求助各位老师:
我想用cp2k做LiPF6+EC等电解液体系的AIMD模拟,先用gromacs(版本VERSION 2024 (single precision))进行能量最小化、NVT弛豫和NPT盒子放缩,但是NPT一直崩溃(多次修改过盒子大小和tau_t, tau_p值),报错内容和相关文件如下,Li离子和PF6-离子、EC分子的top文件和itp文件是用sobtop得到的,用Multiwfn的RESP2分配的电荷:
谢谢各位老师!

ec.top

241 Bytes, 下载次数 Times of downloads: 6

主top文件

em.mdp

360 Bytes, 下载次数 Times of downloads: 1

NVT.mdp

4.79 KB, 下载次数 Times of downloads: 1

NPT.mdp

4.78 KB, 下载次数 Times of downloads: 1

em.gro

9 KB, 下载次数 Times of downloads: 1

mix.gro

9.11 KB, 下载次数 Times of downloads: 0

传给em的初始结构文件

NVT.gro

13.79 KB, 下载次数 Times of downloads: 1

传给NPT的结构文件

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2#
发表于 Post on 2025-5-17 07:14:36 | 只看该作者 Only view this author
完全是瞎算
sobtop产生的拓扑文件怎么可能兼容OPLS-AA,怎么能出现#include "oplsaa.ff/forcefield.itp"。认真看http://sobereva.com/soft/Sobtop/#FAQ2

并且也根本没提供itp文件,别人无法检查
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ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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