cp2k续算结果（1500-2000）不收敛与不续算结果（1-2000）不同

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大佬们 我用CP2K跑分子动力力学，一共2000步 （对应结果是2000.out），并且在1500步生成了一个.restar文件，

用eq.inp跑完2000步后，然后我在另一个文件夹（这个文件夹提交任务时只有.restart文件）里用.restar文件进行续算500步(对应结果500.out，也就是2000.out里的第1500-2000步)，

为什么restar算的500步，和eq.inp最后的500步结果不一样。。一开始scf就跑到最大步数，在2000.out里，1500步左右scf基本都在20步左右收敛




在.restar里，我把：TIMESTEP  9.9999999999999989E-001  改成  TIMESTEP  1，，其他地方都没变

mpirun -np 24 cp2k.popt eq.inp |tee equil.out
mpirun -np 24 cp2k.popt equil-1.restart |tee equil.out
提交指令分别是上面这个两个


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结构是钴酸锂在钴位点掺杂过渡金属

这其实不是你的文件写错，而是分子动力学本身的“可重现性”问题：

热浴／恒温器状态没有一起重启

当你在 1500 步写出 *.restart 文件时，它只包含了原子坐标和速度（以及电子结构部分的波函数重启），但不会保存 CSVR 热浴（或其它恒温器）内部的链变量、随机数状态。在原始的 eq.inp 里，从 1 步到 2000 步，热浴在每一步都会依据上一步的温度偏差去调节速度、生成随机扰动。如果你在 1500 步 dump 出来，再去重启跑 500 步，新热浴一开始会重新生成随机数、重新初始化链变量，调节力度就和原来连续跑的第 1501–2000 步不一样。因此，最后 500 步的轨迹肯定会和 eq.inp 一口气跑完 2000 步时的那 1501–2000 步不一致。

积分器（Verlet／ASPC）不可逆且累积误差不同即便没有热浴，积分算法本身也不是严格可逆的，哪怕你把温度换成 NVE（能量守恒）系综：从 1 步直接跑到 2000 步，累计的四舍五入误差、力场截断/筛选误差，会和你跑 1–1500 步 然后再跑 1501–2000 步 稍微不同。这类数值误差微小，但长时间积累下来，轨迹就会有差别。



上面是gpt给我的回答

如果是这样的话，

（1）那我进行 预平衡（300K） -> 正式MD（800K） 应该怎么做，预平衡完了之后将pos.xyz文件最后一步的原子坐标复制到.inp文件里，然后改一些参数，比如TIMESTEP 、TIMECON、TEMPERATURE(300改到800) 然后再运行吗

（2）这个结构是经过vasp优化之后的结构，还需要进行预平衡吗，可不可以直接800k开始分子动力学

（3）我不明白，为什么重启之后的第一步scf就基本不收敛了（基本都跑到最大步数），难道是因为使用eq.inp跑到1500步之后，结构变得很差？


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好像懂了 是因为没读取wfn文件，但是eq.inp好像并没有生成wfn文件这是为什么