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[新手求助] 单点能的计算问题

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用B3LYP/Def2-TZVPP优化得到的分子结构,没有虚频,用该结构做CBS-QB3的单点计算,正常结束,但出现虚频,请问此能量是否可取,谢谢!

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发表于 Post on 2017-4-1 14:43:44 | 只看该作者 Only view this author
CBS-QB3做的不叫单点计算,它本身已经包含了优化、振动分析过程,算的是热力学量。
虚频应当处理掉,否则数据可能不准。可以先用CBS-QB3自动优化所用的级别手动优化确保没有虚频,然后再把那个结构用于CBS-QB3计算。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-4-1 15:05:34 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 xujian 于 2017-4-1 15:09 编辑
sobereva 发表于 2017-4-1 14:43
CBS-QB3做的不叫单点计算,它本身已经包含了优化、振动分析过程,算的是热力学量。
虚频应当处理掉,否则 ...

sob老师,高斯书上说CBS-Q结构优化用的是MP2/6-31G(d),那CBS-QB3中B3指的是什么,它的结构化化用的是何种方法?麻烦您

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发表于 Post on 2017-4-1 20:29:55 | 只看该作者 Only view this author
xujian 发表于 2017-4-1 15:05
sob老师,高斯书上说CBS-Q结构优化用的是MP2/6-31G(d),那CBS-QB3中B3指的是什么,它的结构化化用的是何 ...

B3就是指换成了B3LYP的几何
B3LYP/6-311G(2d,d,p)

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-4-1 20:50:31 | 只看该作者 Only view this author
liyuanhe211 发表于 2017-4-1 20:29
B3就是指换成了B3LYP的几何
B3LYP/6-311G(2d,d,p)

谢谢,括号里(2d,d,p),这种写法代表什么意思啊? G4方法是用什么方法优化结构啊,第二版的高斯好像没有说明,麻烦您告知一下。

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发表于 Post on 2017-4-1 21:16:13 | 只看该作者 Only view this author
xujian 发表于 2017-4-1 20:50
谢谢,括号里(2d,d,p),这种写法代表什么意思啊? G4方法是用什么方法优化结构啊,第二版的高斯好像没有说 ...

对>3,2,1周期分别用什么极化。
查原文献立刻就知道了

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-4-2 08:53:28 | 只看该作者 Only view this author
liyuanhe211 发表于 2017-4-1 21:16
对>3,2,1周期分别用什么极化。
查原文献立刻就知道了

谢谢老师,刚看了一篇文献,JCP,1999,110,2822,里面是这么描述的,6-3111G(3d2f ,2df ,2p) means 3d2f on the second row, 2df on the first row, and 2p on hydrogen,为何周期性大的原子反而不考虑极化?

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发表于 Post on 2017-4-2 10:11:33 | 只看该作者 Only view this author
xujian 发表于 2017-4-2 08:53
谢谢老师,刚看了一篇文献,JCP,1999,110,2822,里面是这么描述的,6-3111G(3d2f ,2df ,2p) means 3d2f ...


明明是越靠后的用的极化函数越多。
量化文献里习惯把Li~Ne叫做第一周期
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-4-2 10:28:01 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-4-2 10:11
明明是越靠后的用的极化函数越多。
量化文献里习惯把Li~Ne叫做第一周期

好的,谢谢老师

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-4-2 13:54:35 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-4-1 14:43
CBS-QB3做的不叫单点计算,它本身已经包含了优化、振动分析过程,算的是热力学量。
虚频应当处理掉,否则 ...

请问老师,为何我用B3LYP/6-311G(2d,d,p)做过渡态的结构优化和频率分析都是正常结束,做cbs-qb3的时候,用guess=read读取B3LYP/6-311G(2d,d,p)下的chk文件,还会出现L502 SCF不收敛的问题,按理说cbs-qb3结构优化用的就是B3LYP/6-311G(2d,d,p)。

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