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楼主 Author: 王纪峰
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[程序/脚本开发] 可生成任意聚合度线形聚合物结构、拓扑以及电荷的在线程序

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发表于 Post on 2025-10-9 17:20:05 | 只看该作者 Only view this author
求助 status显示success后,下载的all_results.zip里是空的,这是为什么
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发表于 Post on 2025-10-10 17:02:24 | 只看该作者 Only view this author
Xexhauster 发表于 2025-10-9 17:20
求助 status显示success后,下载的all_results.zip里是空的,这是为什么
gAAAAABo53PsIAsBSiZgcwmhXKarzCL ...

我也是今天下午提交的,状态显示成功了,但是下载出来显示是一个空的

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发表于 Post on 2025-10-20 08:59:36 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 牧生 于 2025-10-20 09:06 编辑

gAAAAABo9YWvPKeeu0Woyjb1k5FG9gSi9scycKWyiETrnhqI_D5CUeEZ7h49TszCUccE1tmLRQn5j89Y8tyYpPIbVO6IWRjmz8J0KUvalfOBbFvlFJv4LYdjFl9jDubYh0RqBm8MGKZbZ7GoW1RpkBDT1-HE6J49H5lupV0mL9xUYplSSNNyYLizJ-7iCAQHEPeFNsX378V*So9rm8K3XC6AyZyQL9OWlYm_z6j1_arJcz13-oBgKAKXPRBPT1CPZjq_lFzAYAC-oGBD4olrSbOcFhyRhvKBi_ZOKbjVlzLUw7fSlzG6wZENRJEeJr5Z0C8yfTCpMtKHBIpKWuLCELOs6GLZDoycAaF1k_KGUM8_3A7H9IhP-uwPEpKnr-fL6118suHWf0itGCmUpPAMrvCPuCMmevduo8-VcKpeaJB_An2eqv7AvNiJgkYSMRlzh0PujbSCv8Ue


请帮忙看一下,近日发现生成的聚合物的总电荷不太对劲。。

如上是我用9个不带电的丙烯酰胺和带1个带-1电荷的丙烯酸得到的无规聚合物,但是得到的总电荷为 +7.460962
又菜又爱玩

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发表于 Post on 2025-11-3 16:19:19 | 只看该作者 Only view this author
今天简单使用了一下,挺不错,有几个问题和建议:
1. 今天试的两个例子均出现了原子净电荷不为0的问题,1400左右原子大概会有5个电荷的偏差;
2. 可以添加个选项,不进行原子电荷计算,只输出结构(考虑到有些用户可能只需要结构),这样会降低不必要的机时消耗;
3. 考虑到聚合物这么大的体系,体系优化也没必要使用6-311G**这么大的基组,一般的6-31g*其实就可以,orca中的B97-3c方法是一个很好的选择,或者是xtb的GFN0-xTB方法。
最后,感谢大佬耗费精力做的网页
我见青山多妩媚,料青山见我应如是。

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发表于 Post on 2025-12-5 14:14:48 | 只看该作者 Only view this author
王博,太好用了。诸如CMC-阴离子,聚离子液体等结构的无规共聚也能完全重现出所需要的partial charge。对称共轭位置上也是相等的电荷和同样的力场类型。
此外我完全同意楼上的一个建议,就是给出选项不计算电荷或给出快速的MMFF94电荷,同时保留RESP电荷计算时的大基组,高标准高精度。

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发表于 Post on 2025-12-12 11:32:41 | 只看该作者 Only view this author
进入网页,为什么点击不了generate polymer

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