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[综合交流] 求助:二面角拟合时MM能量曲线计算出来很奇怪

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本帖最后由 lts! 于 2025-9-17 13:04 编辑

对于以下这样的二面角拟合,我首先用gaussian柔性扫描后得到qm曲线,曲线很平滑很正常,但是在算MM能量时,将该处四个二面角的力常数设置为0之后,得到的mm曲线就很异常没有规律,用QM减去MM后也会变得特别奇怪,我发现我在拟合很多简单体系都会遇到这样的问题,一直不知道是哪里出问题了。

图1 二面角拟合对象

图2 qm扫描曲线


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发表于 Post on 2025-9-18 02:33:43 | 只看该作者 Only view this author
一点点简化问题、反复对比找原因
比如把柔性扫描改成刚性扫描、把所有二面角项都去掉再算MM曲线(然后一个个把二面角扭转项加上),等等
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-9-18 14:42:59 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-9-18 02:33
一点点简化问题、反复对比找原因
比如把柔性扫描改成刚性扫描、把所有二面角项都去掉再算MM曲线(然后一个 ...

谢谢老师,我想再问一下这种问题是由于GAFF2预建二面角力常数离实际值偏差比较大导致的吗?

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发表于 Post on 2025-9-18 23:31:36 | 只看该作者 Only view this author
lts! 发表于 2025-9-18 14:42
谢谢老师,我想再问一下这种问题是由于GAFF2预建二面角力常数离实际值偏差比较大导致的吗?

当前用的是周期性的扭转势,谐振势才有力常数的概念
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-9-19 13:12:57 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-9-18 23:31
当前用的是周期性的扭转势,谐振势才有力常数的概念

哦哦不好意思老师,我再学习一下!

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