计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 287|回复 Reply: 5
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[CP2K] 关于使用CP2K优化分子在Cu表面吸附构型时分子断裂的问题

[复制链接 Copy URL]

25

帖子

0

威望

111

eV
积分
136

Level 2 能力者

老师们好,

最近在学习使用CP2K做一些吸附方面的计算,尝试计算一些分子在Cu111面上的吸附构型。但是在做几何优化时发现构型非常难收敛,并且随着优化,分子会发生很诡异的断裂。估计是input文件没写好,想请各位老师看下问题出在哪里。


202509200807274730..png (100.07 KB, 下载次数 Times of downloads: 0)

202509200807274730..png

imicco_Cu111.inp

18.69 KB, 下载次数 Times of downloads: 10

6万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
124703

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2025-9-21 02:32:49 | 只看该作者 Only view this author
Z方向真空区根本不够,完全不能满足MT做二维周期性计算的要求。
PS:如果你参加过北京科音CP2K第一性原理计算培训班(http://www.keinsci.com/KFP),认真复习 “能量的计算及相关问题” 里面 “低维体系的计算” 的部分,对这部分要点讲得极其详细。没这些常识完全没法正确做计算

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

135

帖子

0

威望

1343

eV
积分
1478

Level 4 (黑子)

3#
发表于 Post on 2025-9-22 00:40:35 | 只看该作者 Only view this author
卢老师说的对,你这个体系Z轴至少30. 建议系统学一下吧

25

帖子

0

威望

111

eV
积分
136

Level 2 能力者

4#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-9-22 09:47:34 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-9-21 02:32
Z方向真空区根本不够,完全不能满足MT做二维周期性计算的要求。
PS:如果你参加过北京科音CP2K第一性原理 ...

谢谢sob老师,我尝试将z轴调到30A就正常了,虽然每步计算时间变长了,但scf收敛步数明显变少了。想问下老师z方向的高度设置有没有一些经验方法。比如我这个体系我发现吸附分子的最高点到盒子最高点只要超过15A就可以,那对于其他体系这个经验能否套用?

25

帖子

0

威望

111

eV
积分
136

Level 2 能力者

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-9-22 09:48:14 | 只看该作者 Only view this author
reid 发表于 2025-9-22 00:40
卢老师说的对,你这个体系Z轴至少30. 建议系统学一下吧

谢谢老师,调到30确实可以了

9

帖子

0

威望

55

eV
积分
64

Level 2 能力者

6#
发表于 Post on 2025-9-24 11:33:17 | 只看该作者 Only view this author
下实上虚 你这虚的真空层太少了 经验正常最少十五个吧

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-1-25 17:40 , Processed in 1.963519 second(s), 23 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list