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[波函数分析求助] 求助审稿人问题:IGMH等值面面积和结构之间的关系

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楼主
大家好!

最近投的一篇文章中用IGMH研究了三个碳纳米环(分子1,2,3)和C60的超分子作用,发现实验测的和C60的结合常数(Ka: 1>3>2)与等值面面积(area: 1>3>2)的大小变化趋势一致。


一个审稿人问的问题为:Expandon Structure-Function Links: Discuss how ellipticity impacts cavitysize/shape for C60 encapsulation, using IGMH maps as visual aids.


想请教大家,等值面面积大小代表了碳纳米环和C60 之间的pi-pi相互作用,和碳纳米环自身的结构的关系该怎么讨论呢?我将碳纳米环拟合了圆形,想看一下三个分子和标准圆形的差别,发现它们的结构都非常接近于圆,只有很细微的差别,好像不能用审稿人提到的”椭圆率“来解释差异,想请高人指点一下回复的思路,感谢!

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发表于 Post on 2025-10-10 20:15:28 | 只看该作者 Only view this author
IGMH等值面的形状和相互作用能并没原理上的相关性
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-10-10 21:06:29 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-10-10 20:15
IGMH等值面的形状和相互作用能并没原理上的相关性

感谢老师回答。我实验测了Ka,也计算了相互作用能,发现Ka、相互作用能、IGMH等值面积三者变化趋势一致,然后就提了一下它们可能有一定的相关性

请问sob老师,客体分子都是C60,IGMH等值面大小不同能不能说主要和三个主体碳纳米环分子的结构不同有关?结构和C60的pi轨道更匹配,所以等值面积更大,pi-pi相互作用更强?

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发表于 Post on 2025-10-10 22:52:56 | 只看该作者 Only view this author
lr8616 发表于 2025-10-10 21:06
感谢老师回答。我实验测了Ka,也计算了相互作用能,发现Ka、相互作用能、IGMH等值面积三者变化趋势一致, ...

可以
这篇文章就是生动的例子
全面揭示各种碳环与富勒烯之间独特的pi-pi相互作用!
http://sobereva.com/727http://bbs.keinsci.com/thread-49376-1-1.html
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-10-11 01:28:11 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-10-10 22:52
可以
这篇文章就是生动的例子
全面揭示各种碳环与富勒烯之间独特的pi-pi相互作用!

谢谢老师 我来研究下

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