请教，钙离子交联多糖的体系中钙离子的力场选择什么

Eianghuan · 发表于 Post on 2025-10-22 17:51:37

请教各位老师，我在实验中发现钙离子能够交联我的多糖，现在想用MD模拟微观的过程，多糖用GLYCAM产生了pdb文件并转化为了gromacs所需的拓扑文件，请问钙离子应该用什么力场比较合适呀？

Eianghuan · 发表于 Post on 2025-10-24 16:19:39

我尝试了Amber99sb.ff，能够和多糖的磺酸基良好结合，但不知道合不合理，有同样问题的同学可以尝试一下

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[GROMACS] 请教，钙离子交联多糖的体系中钙离子的力场选择什么