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[ORCA] ORCA分子动力学模块怎么结合xTB跑模拟?

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我是ORCA 6.1版本,在手册中分子动力学部分(https://www.faccts.de/docs/orca/ ... ynamics/moldyn.html)搜索xTB仅搜索到在ORCA 4.2版本中更新了MD中的xTB,没有检索到如何使用。在inp文件顶部输入! MD XTB后报错无法优化,请问大家怎么在MD模块中使用xTB呢,我是想参考这篇帖子http://bbs.keinsci.com/thread-16255-1-1.html做构象搜索。

  • [color=var(--darkColor)]Stefan Grimme’s xTB method can now be used in the MD module, allowing fast simulations of large systems.


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发表于 Post on 2025-10-29 18:35:24 | 只看该作者 Only view this author
应当查怎么做xTB的单点或梯度计算,以及怎么做MD计算,再把两部分关键词合并起来写。
手册不可能事无巨细地列举每两个功能同时用的时候关键词怎么写。在一章讲了怎么做xTB计算,另一章讲了怎么做MD计算,这就算手册尽到告知用户的义务了,如何把两者合并起来写是用户的事。
此外,遇到报错信息,必须自行分析报错信息的含义(当成做英语阅读理解题),往往通过报错信息就能知道哪里写错了
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-10-29 21:37:18 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2025-10-29 18:35
应当查怎么做xTB的单点或梯度计算,以及怎么做MD计算,再把两部分关键词合并起来写。
手册不可能事无巨细 ...

是的是的,我以为ORCA是直接内置了xTB的所有方法所以想当然了。查了3.5节(https://www.faccts.de/docs/orca/ ... /semiempirical.html)和https://xtb-docs.readthedocs.io/en/latest/setup.html才发现还需要手动改个otool_xtb,添加系统变量才可以使用,谢谢!

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发表于 Post on 2025-10-30 09:06:39 | 只看该作者 Only view this author
daisuwei 发表于 2025-10-29 21:37
是的是的,我以为ORCA是直接内置了xTB的所有方法所以想当然了。查了3.5节(https://www.faccts.de/docs/o ...

ORCA 6.1开始本来就是直接内置了GFN-xTB方法,都不需要调用外部程序

北京科音高级量子化学培训班(http://www.keinsci.com/KAQC)里我还专门讲了:

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-10-30 11:00:03 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-10-30 09:06
ORCA 6.1开始本来就是直接内置了GFN-xTB方法,都不需要调用外部程序

北京科音高级量子化学培训班(htt ...

sob老师好,我想仿照您用http://bbs.keinsci.com/thread-16255-1-1.html中的GFN0-xTB做构象搜索,之前我试过只写关键词XTB是采用的GFN2-xTB,好像是GFN0是没有内置的,我昨天加了一个系统变量才可以使用

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发表于 Post on 2025-10-31 05:51:36 | 只看该作者 Only view this author
daisuwei 发表于 2025-10-30 11:00
sob老师好,我想仿照您用http://bbs.keinsci.com/thread-16255-1-1.html中的GFN0-xTB做构象搜索,之前我 ...

我的帖子里明明是xtb直接跑的动力学,而不是靠ORCA来调用
跑GFN-xTB的动力学用ORCA比起xtb直接跑慢得多。你的行为十分莫名其妙
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2025-10-31 10:03:17 | 只看该作者 Only view this author
daisuwei 发表于 2025-10-29 21:37
是的是的,我以为ORCA是直接内置了xTB的所有方法所以想当然了。查了3.5节(https://www.faccts.de/docs/o ...

你看一下 https://www.faccts.de/docs/orca/ ... _steps/install.html 就知道,ORCA 6.0.0需要手动安装xtb到特定位置并改名为otool_xtb,ORCA 6.0.1和ORCA 6.1.0都已经自带了xtb。但你如果是想要做构象搜索的话,要么直接通过crest调用xtb,这种做法压根牵扯不到ORCA,要么就用ORCA 6引入的GOAT功能( https://doi.org/10.1002/anie.202500393 )。

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