在berendsen压浴下出现警告不适用

huangzi · 发表于 Post on 2025-10-29 21:15:39

各位老师们，我在进行预平衡阶段采用了berendsen的压浴方法，但出现如下警告，目前暂时不打算用c-rescale的压浴，因为我模拟的几个体系均采用berendsen的方法且已经模拟完成，想追求一样的条件，想问问老师们我可以忽视这个警告直接进行模拟吗

student0618 · 发表于 Post on 2025-10-29 21:27:11

本帖最后由 student0618 于 2025-10-29 21:31 编辑

实际上问题不大，但很可能被对理论很较真的审稿人批。

论坛有不少人问过，可参考sob老师的回答如http://bbs.keinsci.com/forum.php ... 0&fromuid=64740

huangzi · 发表于 Post on 2025-10-29 21:46:05

student0618 发表于 2025-10-29 21:27
实际上问题不大，但很可能被对理论很较真的审稿人批。

论坛有不少人问过，可参考sob老师的回答如http:// ...

好的谢谢老师，我看到sob老师说c-rescale很理想、最普适，想问问老师假如我更换c-rescale，是可以直接一直使用的吗？不像berendsen一样在平衡之后更换p-r压浴

sobereva · 发表于 Post on 2025-10-30 09:07:34

huangzi 发表于 2025-10-29 21:46
好的谢谢老师，我看到sob老师说c-rescale很理想、最普适，想问问老师假如我更换c-rescale，是可以直接一 ...

可以
如这页北京科音分子动力学与GROMACS培训班（http://www.keinsci.com/KGMX）所示，全过程通用：

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[GROMACS] 在berendsen压浴下出现警告不适用