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[综合交流] TED(total energy distribution)的计算软件问题?

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楼主
TED的计算看了很多资料都是用PQS做的,但是这个软件的试用版只能算不超过25个原子的体系,不知道有没有其他可替代的软件。我主要是用来对振动光谱进行指认的,之前有用过PED方法,用的是开源的VEDA软件,算的是7分子簇的,发现这种方法在低频区间(低于100个波数)的振动指认和GV看到的不符,所以想用其他的方法看一下。

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发表于 Post on 2017-4-25 10:25:12 | 只看该作者 Only view this author
做PED分析的一些程序Molvib,GAR2PED,VEDA,fcart01...
http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=276

Gaussian中分析振动模式成份的关键词freq=intmodes
http://sobereva.com/106
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ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-4-27 10:57:24 | 只看该作者 Only view this author
多谢,我用gar2ped做了相应的分析,对象有56个原子的分子簇,一共有162种振动模式,发现那些振动的定义我不是狠明白,伸缩不用管直接1,enter就行,2 torsion基本可以理解 3,4基本和甲基有关的,5连在C上的双键其他两个对称  6 双键其他两个不对称 7 。。8 氨基 的变形  9 亚氨基的变形  10,11,12 4,5,6元环  13 OH 弯曲 X-O-H  我研究对象分子之间有氢键,C=0~~H-N ,是否需要设定这个模式呢? 1,4,15,16,17  和环有关系的  18 spiro-atom 螺旋原子  19 线性弯曲 这个功能不明白 要输入4个原子的序号ABCD=  ,解释是bends in and perpendicular to A-C-D plane 面内和垂直于面的弯曲?由于gar2ped的例程太少了,就是参照您的帖子来学习的,有很多疑惑都不知道怎么去解决。

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