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[Gaussian/gview] 求助:Gaussian自由基污染物反应搜索过渡态不收敛

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本帖最后由 Yiliuvito 于 2025-11-14 10:51 编辑

各位老师好!我现在正在尝试计算羟基自由基进攻SMX中的N-S键反应的过渡态,所采用的计算方式如下:
首先用Gview构建羟基自由基和SMX分子,简单优化后把OH摆在靠近N-S键的位置上,设置整个体系自选多重度为2,关键词选择 opt(calcall,ts,noeigen) b3lyp/6-31g(d,p) 考虑溶剂化效应和色散校正。在第一步计算的时候出现Link9999的报错,遂检查能量震动的优化曲线,发现虽然有波动但是有收敛的趋势,所以决定取这一步优化能量的最小结果再添加gdiis关键词继续优化,但是出现了Linear angle in Bend的报错。在这之前曾经通过去掉溶剂化,先几何优化整个体系再寻找过渡态的方式找到一个“ts结构”,但是在进行IRC的过程中也是出现不收敛的问题,恳请各位老师帮帮忙指点,万分感谢!
我自己想的是接下来通过两种方式尝试:
1.首先自己用优化的方式先优化结构,然后在利用相同关键词找ts(已尝试,还是失败了,问题同上)
2. 请问是不是在N-S键的断裂过程中应当考虑断裂之后的N的饱和度?
3. 后附上我的建模和反应过程


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发表于 Post on 2025-11-14 11:24:55 | 只看该作者 Only view this author
结构画错了。文献上硫上有两个氧,你为什么是两个氢?
而且氨基的二面角也不对。好好复习一下有机教材,苯胺的三维结构是什么样的,然后重新画氨基部分。磺酰胺的二面角也不对,仔细复习有机教材有关酰胺的部分
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-11-14 12:36:09 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2025-11-14 11:24
结构画错了。文献上硫上有两个氧,你为什么是两个氢?
而且氨基的二面角也不对。好好复习一下有机教材,苯 ...

谢谢老师的指点,我实在是太粗心了,耽误时间实在不好意思

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