vmd如何选择离某个残基较近的残基？

kjxwl3 · 发表于 Post on 2017-4-26 16:58:10

各位vmd大神：
向你们请教一下，如何在vmd里面选择离某个残基较近的残基：
我的乙醇的残基名为MET，冠醚的残基CRO，我现在想选择里CRO残基较近的MET残基，我写的选择语句是：
resname MET within 20 of resname CRO.
结果报错，这个该怎么写？

ruanyang · 发表于 Post on 2017-4-26 19:36:35

resname MET and (within 20 of resname CRO)
没事多看手册

kjxwl3 · 发表于 Post on 2017-4-30 20:43:05

ruanyang 发表于 2017-4-26 19:36
resname MET and (within 20 of resname CRO)
没事多看手册

我才用类似的方式选取残基，resname MOL and (within 10 of residue 0)，得到的图很奇怪，感觉有几个乙醇分子都被分开了。附件是我的最后一帧的pdb，我创建的这个representation的图也在附件中。

ruanyang · 发表于 Post on 2017-5-1 08:57:36

same resid as XXX and (resname MET and (within 20 of resname CRO))

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[VMD] vmd如何选择离某个残基较近的残基？