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[新手求助] ORCA计算UIO团簇,一直没法优化好

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Level 3 能力者

一开始固定了Zr-O,但没有加溶剂,一优化就出现配体团在一起,结构完全变形,也会报negative HOMO-LUMO,查了一下是没有溶剂极化,导致COOH相互之间吸引;
现在加了DMF溶剂,一直报错negative HOMO-LUMO,想请教各位大大帮忙看下输入文件有没有问题,拜托了!
! B97-3c opt noautostart miniprint slowconv  KDIIS
! CPCM(dmf)
%maxcore     1000
%pal nprocs   32 end
%geom
  Constraints
  { C      0 C }
  { C      1 C }
  { C      2 C }
  { C      3 C }
  { C      6 C }
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  end
end
* xyz   0   1
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O    -26.29700000   27.07700000    5.18100000
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O    -22.34700000   25.55000000    6.55000000
O    -22.20200000   32.58400000    5.33700000
O    -24.88600000   33.12200000    8.16200000
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O    -22.32000000   25.98200000    9.21200000
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C    -21.36400000   32.77900000    9.10600000
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C    -21.41000000   26.46300000    9.97400000
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O    -23.63200000   30.12900000    5.69700000
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Zr   -25.42200000   29.10700000    5.58500000
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Zr   -23.58000000   31.78900000    6.91900000
Zr   -21.91300000   28.99900000    5.58100000
Zr   -25.40100000   29.66600000    9.05300000
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C    -30.35700000   29.51000000    8.55400000
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C    -30.37300000   29.13200000    6.16300000
C    -26.36900000   34.09600000    9.73200000
C    -26.40300000   33.10700000    3.55500000
C    -26.92400000   24.79200000    5.16500000
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C    -20.63600000   25.51100000   10.80900000
C    -23.61600000   30.47200000   13.20000000
C    -17.67500000   28.96600000    7.33500000
C    -26.89300000   25.70600000   10.82700000
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C    -20.69000000   24.59600000    5.15300000
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H    -32.26900000   29.61400000    9.51000000
H    -32.29700000   28.94000000    5.24500000
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C    -26.77800000   23.49600000    5.69200000
C    -24.82000000   30.65200000   13.90500000
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C    -22.39900000   30.60300000   13.89500000
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C    -20.21100000   36.31000000    9.88900000
C    -19.27000000   36.09000000   10.90900000
C    -19.02200000   34.77300000   11.33100000
C    -19.70000000   33.70000000   10.74700000
C    -16.95300000   29.08400000    8.53700000
C    -15.56000000   28.96200000    8.54400000
C    -14.85700000   28.72000000    7.35100000
C    -15.57700000   28.60000000    6.15100000
C    -16.97000000   28.72200000    6.14300000
C    -19.80900000   32.39100000    2.58600000
C    -19.15700000   33.22500000    1.67200000
C    -19.37000000   34.61300000    1.69200000
C    -20.24800000   35.15100000    2.65000000
C    -20.90100000   34.31800000    3.56400000
C    -19.66800000   24.76200000    4.20100000
C    -18.95500000   23.65900000    3.72300000
C    -19.25100000   22.36300000    4.17900000
C    -20.26100000   22.19700000    5.14100000
C    -20.97400000   23.29900000    5.62000000
C    -19.65600000   25.97400000   11.70500000
C    -18.92100000   25.07400000   12.48200000
C    -19.15300000   23.69100000   12.38900000
C    -20.12100000   23.22600000   11.48200000
C    -20.85600000   24.12500000   10.70400000
C    -26.06900000   35.39600000    9.28700000
C    -26.66700000   36.50800000    9.88600000
C    -27.57600000   36.34700000   10.94500000
C    -27.87800000   35.04900000   11.39000000
C    -27.28100000   33.93700000   10.79200000
C    -27.38600000   32.64700000    2.66000000
C    -27.98500000   33.52200000    1.75000000
C    -27.62500000   34.87900000    1.71800000
C    -26.63600000   35.33900000    2.60400000
C    -26.03500000   34.46500000    3.51400000
H    -28.00400000   25.98500000    3.70800000
H    -29.34100000   24.14100000    2.85700000
C    -29.31300000   21.51900000    3.68600000
H    -27.42000000   21.45400000    5.63800000
H    -26.06200000   23.29400000    6.48000000
H    -25.77500000   30.56100000   13.40400000
H    -25.75200000   31.08600000   15.78300000
C    -23.58400000   31.40200000   17.40800000
H    -21.43400000   30.99900000   15.76400000
H    -21.45300000   30.47400000   13.38600000
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H    -20.42600000   37.31300000    9.54200000
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H    -18.30300000   34.57000000   12.11600000
H    -19.48400000   32.69900000   11.09800000
H    -17.46100000   29.26900000    9.47500000
H    -15.03400000   29.05700000    9.48600000
C    -13.38200000   28.59300000    7.35300000
H    -15.06600000   28.41300000    5.21600000
H    -17.49200000   28.62300000    5.19900000
H    -19.62600000   31.32500000    2.53500000
H    -18.48900000   32.77900000    0.94600000
C    -18.68700000   35.48900000    0.71300000
H    -20.43300000   36.21700000    2.69100000
H    -21.57500000   34.76700000    4.28200000
H    -19.41500000   25.74600000    3.82400000
H    -18.17600000   23.81900000    2.98700000
C    -18.47900000   21.20200000    3.66800000
H    -20.48800000   21.22000000    5.54800000
H    -21.74400000   23.13400000    6.36300000
H    -19.45300000   27.03200000   11.80800000
H    -18.17600000   25.46100000   13.16600000
C    -18.35800000   22.74700000   13.21400000
H    -20.29600000   22.16700000   11.34800000
H    -21.59000000   23.73000000   10.01300000
H    -25.36900000   35.55700000    8.47700000
H    -26.41400000   37.49500000    9.51900000
C    -28.20500000   37.52200000   11.59000000
H    -28.57300000   34.89100000   12.20500000
H    -27.53100000   32.95200000   11.16600000
H    -27.69300000   31.60800000    2.65900000
H    -28.74000000   33.13700000    1.07500000
C    -28.25800000   35.79300000    0.73400000
H    -26.30200000   36.36800000    2.58000000
H    -25.27200000   34.85300000    4.17700000
C    -27.88200000   26.22800000   11.68100000
C    -28.66800000   25.37700000   12.46600000
C    -28.48400000   23.98600000   12.41500000
C    -27.49400000   23.46300000   11.56400000
C    -26.70900000   24.31200000   10.77900000
H    -28.05500000   27.29500000   11.74400000
H    -29.42100000   25.81200000   13.11100000
C    -29.32300000   23.08900000   13.24200000
H    -27.32600000   22.39500000   11.50400000
H    -25.96000000   23.87300000   10.13300000
O    -18.84900000   21.49400000   13.58900000
O    -17.24400000   23.06900000   13.59000000
O    -28.86600000   20.38700000    3.74900000
O    -30.58500000   21.70100000    3.13700000
O    -19.02100000   19.91600000    3.62000000
O    -17.34000000   21.36700000    3.26900000
O    -22.76500000   27.62600000   -3.44500000
O    -24.73700000   28.67700000   -3.69400000
O    -28.69000000   35.34200000   -0.31200000
O    -28.38800000   37.16400000    0.97100000
O    -17.83200000   34.93500000   -0.24200000
O    -18.87100000   36.69500000    0.73300000
O    -27.93700000   38.65000000   11.20700000
O    -29.10500000   37.34400000   12.64200000
O    -22.52700000   31.52100000   18.00600000
O    -24.78900000   31.56800000   18.09400000
O    -29.15900000   21.88000000   13.19800000
O    -30.30600000   23.62400000   14.07600000
O    -12.75600000   28.70200000    8.39500000
O    -12.70100000   28.34900000    6.15800000
O    -34.56900000   29.39200000    8.43300000
O    -34.65800000   29.02700000    6.20000000
C    -33.95600000   29.23800000    7.38800000
O    -17.61900000   36.98700000   12.54600000
O    -18.76100000   38.36600000   11.16000000
H    -19.83100000   21.36000000   13.38800000
H    -30.96000000   22.63100000    3.27300000
H    -20.01500000   19.88100000    3.80500000
H    -25.39100000   29.26600000   -3.19600000
H    -28.16100000   37.44100000    1.91700000
H    -17.43800000   35.63300000   -0.86300000
H    -29.46400000   38.22100000   13.00100000
H    -24.65300000   31.78300000   19.07500000
H    -30.81100000   22.91100000   14.59200000
H    -11.69800000   28.28600000    6.28800000
H    -35.66300000   29.02200000    6.33600000
H    -17.19200000   37.84000000   12.89000000
H    -20.81700000   31.18500000    7.00200000
H    -26.37400000   31.35700000    7.00300000
H    -23.69800000   27.83700000   10.37700000
H    -23.73400000   26.95100000    4.89400000
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发表于 Post on 2025-11-23 02:15:26 | 只看该作者 Only view this author
跟溶剂毫无直接关系
关键的是用簇模型计算时必须把边缘的原子冻住,才能确保维持晶体的结构状态、避免坍塌。冻结Zr-O毫无意义
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-11-23 11:20:06 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 Biubiubiu123 于 2025-11-23 13:49 编辑
sobereva 发表于 2025-11-23 02:15
跟溶剂毫无直接关系
关键的是用簇模型计算时必须把边缘的原子冻住,才能确保维持晶体的结构状态、避免坍塌 ...

谢谢sob老师,那我直接固定苯环的碳,是不是就可以了呀,红色的是我固定的区域。结构为直接从优化好的uio中取出

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发表于 Post on 2025-11-23 13:18:50 | 只看该作者 Only view this author
借楼问一个问题:这样冻结边缘原子之后再做振动分析和热力学计算有意义吗?如果振动分析出现虚频怎么处理?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-11-23 13:51:17 | 只看该作者 Only view this author
Ferrocene 发表于 2025-11-23 13:18
借楼问一个问题:这样冻结边缘原子之后再做振动分析和热力学计算有意义吗?如果振动分析出现虚频怎么处理?

我刚开始学,之前用两个Zr6做中心优化没问题,想换一种方式就出问题了,想搞明白咋回事

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发表于 Post on 2025-11-24 02:35:13 | 只看该作者 Only view this author
Biubiubiu123 发表于 2025-11-23 11:20
谢谢sob老师,那我直接固定苯环的碳,是不是就可以了呀,红色的是我固定的区域。结构为直接从优化好的uio ...

我都明确说了冻结簇的边缘,即被截断的地方,冻中间区域的干嘛
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-11-24 10:06:45 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-11-24 02:35
我都明确说了冻结簇的边缘,即被截断的地方,冻中间区域的干嘛

谢谢版主大大,昨天已经解决,感恩!!

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