VASP5.4.4 编译总结

NEFU

abin 发表于 2018-8-18 21:50
我试了 没有问题。

CentOS intel2015 vasp544

您好，我是在超算集群上编译的，intel2017和cuda9.2，正常编译VASP_GPU,显卡型号p100，可以正常运行，但是加入vtst后再编译就会编译错误，报错信息如上条消息，我的makefile如下，请问方便把您的make贴出来看一下吗？我主要计算过渡态，没vtst很不方便 ,....卡我很久了......


# Precompiler options
CPP_OPTIONS= -DHOST=\"LinuxIFC\"\
             -DMPI -DMPI_BLOCK=16000 \
             -Duse_collective \
             -DscaLAPACK \
             -DCACHE_SIZE=16000 \
             -Davoidalloc \
             -Duse_bse_te \
             -Dtbdyn \
             -Duse_shmem

CPP        = fpp -f_com=no -free -w0  $*$(FUFFIX) $*$(SUFFIX) $(CPP_OPTIONS)

FC         = mpiifort
FCL        = mpiifort -mkl=sequential -lstdc++

FREE       = -free -names lowercase -heap-arrays 64

FFLAGS     = -assume byterecl -w
OFLAG      = -O2
OFLAG_IN   = $(OFLAG)
DEBUG      = -O0

MKL_PATH   = $(MKLROOT)/lib/intel64
BLAS       =
LAPACK     =
BLACS      = -lmkl_blacs_intelmpi_lp64
SCALAPACK  = $(MKL_PATH)/libmkl_scalapack_lp64.a $(BLACS)

OBJECTS    = fftmpiw.o fftmpi_map.o fft3dlib.o fftw3d.o

INCS       =-I$(MKLROOT)/include/fftw

LLIBS      = $(SCALAPACK) $(LAPACK) $(BLAS)


OBJECTS_O1 += fftw3d.o fftmpi.o fftmpiw.o
OBJECTS_O2 += fft3dlib.o

# For what used to be vasp.5.lib
CPP_LIB    = $(CPP)
FC_LIB     = $(FC)
CC_LIB     = icc
CFLAGS_LIB = -O
FFLAGS_LIB = -O1
FREE_LIB   = $(FREE)

OBJECTS_LIB= linpack_double.o getshmem.o

# For the parser library
CXX_PARS   = icpc

LIBS       += parser
LLIBS      += -Lparser -lparser -lstdc++

# Normally no need to change this
SRCDIR     = ../../src
BINDIR     = ../../bin

#================================================
# GPU Stuff

CPP_GPU    = -DCUDA_GPU -DRPROMU_CPROJ_OVERLAP -DUSE_PINNED_MEMORY -DCUFFT_MIN=28 -UscaLAPACK

OBJECTS_GPU = fftmpiw.o fftmpi_map.o fft3dlib.o fftw3d_gpu.o fftmpiw_gpu.o

CC         = icc
CXX        = icpc
CFLAGS     = -fPIC -DADD_ -Wall -openmp -DMAGMA_WITH_MKL -DMAGMA_SETAFFINITY -DGPUSHMEM=300 -DHAVE_CUBLAS

CUDA_ROOT  = /gpfs/home/xlwang/programs/cuda9.2
NVCC       := $(CUDA_ROOT)/bin/nvcc -ccbin=icc
CUDA_LIB   := -L$(CUDA_ROOT)/lib64 -lnvToolsExt -lcudart -lcuda -lcufft -lcublas

GENCODE_ARCH    := -gencode=arch=compute_30,code=\"sm_30,compute_30\" \
                   -gencode=arch=compute_35,code=\"sm_35,compute_35\" \
                   -gencode=arch=compute_60,code=\"sm_60,compute_60\"

MPI_INC    = $(I_MPI_ROOT)/include64/

abin

NEFU 发表于 2018-8-18 22:24
您好，我是在超算集群上编译的，intel2017和cuda9.2，正常编译VASP_GPU,显卡型号p100，可以正常运行，但 ...

没有什么特殊的。
就是按照这里的提示操作。

http://theory.cm.utexas.edu/vasp/installation.html
http://cms.mpi.univie.ac.at/wiki ... de.linux_intel_cuda

我没有GPU设备， 无法测试GPU部分是否工作正常。

zugehaomeng

您好，我看了您的VASP 5.4.4 编译总结。在这里有些问题，5.4.4里面的README说先复制makefile.include.intel到makefile，编辑修改后make all。然后复制makefile.include.linux_intel_cuda 到makefile.include，再进行make gpu。但是现在VASP5.4.4版里的makefile.include.intel中GPU也包含在内，而且arch文件夹下也没有那个后缀为cuda的文件了请问您对GPU那块儿是怎么处理的呢？是将makefile修改完后，先make all再直接make gpu吗？

caixinzhang

NEFU 发表于 2018-8-18 13:29
请问楼主GPU版的vasp5.4.4是否能成功添加编译vtst，我试了一下报错如下：

请问你现在编译VTST成功了吗？我碰到的情况和你一样

五十八

zugehaomeng 发表于 2018-8-30 20:54
您好，我看了您的VASP 5.4.4 编译总结。在这里有些问题，5.4.4里面的README说先复制makefile.include.intel ...

VASP 544中 makefile 最后一部分就是GPU的部分 541中是分开的

yxf

感谢！学习了

心辉

作者有赝势库么？
或者说 您能告诉我，赝势库在vasp安装好的哪里么？

Libesi

您好，请问
CPP_OPTIONS= -DHOST=\"LinuxIFC\"\
             -DMPI -DMPI_BLOCK=16000 \
             -Duse_collective \
             -DscaLAPACK \
             -DCACHE_SIZE=16000 \
             -Davoidalloc \
             -Duse_bse_te \
             -Dtbdyn \
             -Duse_shmem
中，原make.include文件中  -DMPI -DMPI_BLOCK=8000 \
                                               -DCACHE_SIZE=4000\
这从8000改到16000；4000改到16000；改变的数字是什么意思呢？改了以后有什么影响么？谢谢～

afeng

各种新的开始，小白新上路

灰飞的旋律

这么说的话，那买机器同样主频和核心数的还是V4的更划算些，那点UPI速度的提升不明显吧。金牌支持AVX512, V4不支持。但是金牌支持6通道内存，以单节点双核来说，12通道比8通道计算速度会有多大提升。不过我测试过8通道比四通道能提升40%左右。另外，这个提升不明显会不会和其他硬件的而配置还有关系？？
INTEL官网有个测试对比，不知道靠不靠谱

附上2697V4和6148的参数

觉得不靠谱这对比。6148主频高而且核心数还多。

搞理论的

请教一下：
-xCORE-AVX2
-xCORE-AVX512  
加到哪个参数后面？

澄海霸王龙

lukewithyou 发表于 2017-8-18 12:24
路过，问问楼主大大，请问在编译滴时候（正常版本不是gpu计算）出现了这个问题（我是在学校集群编译，之前 ...

你好，请问解决了嘛