关于amorphous体系切表面扫描最近邻原子和次近邻原子扫描半径的问题

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附件中有我的POSCAR，表面信息和表面这些原子的间距文件，这是一个amorphous的表面，我的需求是通过定义两个扫描半径，分别得到位于最高原子对应水平面中各网格点最近邻原子数和次近邻原子数两个用于喂给机器学习的参数，我该如何得到这两个需要的扫描半径呢，这个是有一个理论能计算得到这两个数值还是通过不断进行测试才能得到？感谢各位老师回答问题