[综合交流] 蛋白质内部原子之间静电相互作用是否需要考虑屏蔽作用

8 帖子	0 威望	101 eV

积分: 109

Level 2 能力者

发消息 Send PM

电梯直达 Go to

楼主

发表于 Post on 2026-1-22 19:59:34 | 只看该作者 Only view this author 回帖奖励

|倒序浏览 Reverse view |阅读模式 Reading model

本帖最后由 ZDcccA 于 2026-1-22 20:02 编辑

PB隐式溶剂模型中蛋白质内部介电常数往往设置为2~4，Amber力场静电相互作用介电常数默认为1，但理论上蛋白质内部是非均匀介质，介电常数和残基性质和临近环境等有关，应该是位置的函数。

这种约化（例如介电常数=1，不考虑静电屏蔽作用）是否会导致蛋白质内部原子之间静电相互作用的计算存在误差？是否会导致基于PB模型的静电势计算存在误差？

如果是的话，是否有解决方案呢？比如计算蛋白质内部介电常数的分布？

收藏 Add to favorites0

回复 Reply

举报 Report

返回列表 Return

		自动登录 Automatic login	找回密码 Forget password
密码 Password			注册 Register