请教生物毒性模拟方法

xcgotk

小分子物质单物质可以使用ECOSAR，如果想要做多个小分子复合毒性，高分子如COF，以及小分子+COF的复合毒性有什么方法吗

ABetaCarw

据我所知，目前没有针对你说的这种情形的QSAR QSTR工具
另外 我们要搞清楚，伤害 和 毒害的区别，比如把玻璃丝吞进去 人会死，但是不是毒死的。你这里的高分子就算对人体有害 那也不是毒害 那么也不应该用QSTR去预测。
然后就是，COF如果有减少毒性是否有可能是对小分子的结合，导致游离小分子变少了 从而导致的毒性看似变弱了。毒性的评价，在你的这个体系中 不是按照你投了多少料来判定，而是在比如溶剂中有效的游离态的。COF让你有效作用的浓度变低了，这种 减少毒性 建议从 结合  常数等角度去分析吧。

门外汉的一家之言 ，如有错误，笑笑我便罢了

xcgotk

ABetaCarw 发表于 2026-3-30 18:19
据我所知，目前没有针对你说的这种情形的QSAR QSTR工具
另外 我们要搞清楚，伤害 和 毒害的区别，比如把玻 ...

感谢您的回复，目前我们考虑的是减毒就是COF与分子结合，我会结合您的意见继续学习

sobereva

COF与分子结合这种问题如果想从微观机制研究，适合跑分子动力学，用诸如GROMACS，并且Multiwfn支持的mIGM、amIGM、静电势、EDA-FF等分析方法（参考比如下文）还可以对结合机制做深入解释
Angew. Chem.上发表了全面介绍各种共价和非共价相互作用可视化分析方法的综述
http://sobereva.com/746（http://bbs.keinsci.com/thread-54361-1-1.html）

xcgotk

sobereva 发表于 2026-3-31 06:09
COF与分子结合这种问题如果想从微观机制研究，适合跑分子动力学，用诸如GROMACS，并且Multiwfn支持的mIGM、 ...

好的，谢谢老师，我再学习一下