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楼主 Author: 2329568177
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[ORCA] 求助:为什么同一分子结构,添加溶剂模型时 SCF 无法收敛,但不加溶剂计算成功

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2026-5-11 14:51:51 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2026-5-10 22:15
这种体系完全不需要做振动分析,根据原子类型匹配的bond/angle/dihedral参数通常在AMBER力场里一般都有现 ...

老师,那我用优化好的结构继续做个二面角势能扫描吗?请问老师有没有相关的博文(拟合成周期性扭转势)我去学一下
! B3LYP-D3/def2-SVP Opt
%geom
    Scan  
        D 1 5 7 9 = 0.0, 360.0, 10.0
    end
end
%maxcore 1000  
%pal nprocs 8 end
* xyz 3 1  
坐标
*

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2026-5-11 21:33:37 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2026-5-10 22:15
这种体系完全不需要做振动分析,根据原子类型匹配的bond/angle/dihedral参数通常在AMBER力场里一般都有现 ...

老师,做非标准氨基酸力场文件,还需要做势能面扫描拟合成周期性扭转势吗?非标准氨基酸残基封端后应该也需要重新做几何优化,单点计算和拟合电荷吧。

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发表于 Post on 2026-5-12 00:26:32 | 只看该作者 Only view this author
2329568177 发表于 2026-5-11 21:33
老师,做非标准氨基酸力场文件,还需要做势能面扫描拟合成周期性扭转势吗?非标准氨基酸残基封端后应该也 ...

取决于缺不缺合理的二面角扭转势参数。倘若GAFF/GAFF2/AMBER里根据原子类型能匹配到合适的,并且参数较准确(如果此残基的构象不是研究重点,不准确也没大问题),或者标准力场参数文件里没有但网上能找到某些文章提供的相应情况的扭转势,就用不着自己拟合

用Multiwfn对非标准残基算RESP电荷之前通常需要先优化封端的模型体系的几何结构
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