用ABClsuter+xBT对化学团簇进行全局优化

局部的人 · 发表于 Post on 2017-11-15 13:47:59

信谢谢张老师~

ttxx · 发表于 Post on 2017-12-12 11:08:05

本帖最后由 ttxx 于 2017-12-12 15:57 编辑

老师厉害

Daniel_Arndt · 发表于 Post on 2019-6-7 00:34:19

张老师，我想问一下，lego模块使用的$out$文件的格式要求。我知道这是一个xyz格式的文件，我想了解一下这个文件是不是要求第二行只有能量的数值，除此之外没有任何字符？我是想用lego结合xTB搜索一下一个药物分子在溶剂中形成的团簇。

yjmaxpayne · 发表于 Post on 2019-6-7 16:40:13

越来越强大了哈，看来可以很好的拿来做分子团簇的研究了。 XTB的非键相互作用也是很不错的。

莫落 · 发表于 Post on 2019-6-10 11:37:43

coolrainbow 发表于 2017-6-3 05:44
不知道你等了多久，我是等了一个星期才收到回复的。你可以再等等。如果还没有回应我可以给你发一个

你好！我也没有收到回复，请问是否可以分享一下GFN-xTB这个软件包吗？我的邮箱是475161626@qq.com

薛定谔的老猫 · 发表于 Post on 2019-10-30 09:04:26

您好，在超算上面安装ABcluster和xTB之后进行原子团簇的搜索，按照您上面给出的第一个例子测试，但是输出文件中没有能量，最后面按照能量重新排列的时候，能量一栏显示的是nan，提示找不到xtb.coord 文件，我又试着把调用xtb优化命令中的xxx用cu4o4替换，但是还是一样的错误，请问是什么原因呢？感谢！

archer · 发表于 Post on 2020-9-24 15:43:15

回复楼上：
查看当前路径下的*.gjf是空的，原因是.inp中的 gaussian2xyz和xyz2gaussian路径不对。错误信息在nohup.out里查看

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[综合交流] 用ABClsuter+xBT对化学团簇进行全局优化

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